More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0621 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  54.29 
 
 		 1469 aa  1535    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.95 
 
 		 1473 aa  1050    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0422166 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  100 
 
 		 1715 aa  3471    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28810  putative DNA helicase  40.59 
 
 		 1707 aa  1146    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0849671  decreased coverage  0.0000000181114 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  77.22 
 
 		 369 aa  383  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.61 
 
 		 637 aa  270  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.42 
 
 		 634 aa  267  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.76 
 
 		 451 aa  266  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.47 
 
 		 626 aa  263  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.91 
 
 		 793 aa  262  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 		 593 aa  260  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.46 
 
 		 606 aa  260  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 		 593 aa  260  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.02 
 
 		 724 aa  258  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  36.47 
 
 		 493 aa  258  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.57 
 
 		 721 aa  258  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.77 
 
 		 594 aa  257  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 		 647 aa  255  6e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1895  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.62 
 
 		 633 aa  255  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.47 
 
 		 642 aa  254  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.77 
 
 		 707 aa  254  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.62 
 
 		 634 aa  254  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.66 
 
 		 592 aa  254  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.98 
 
 		 685 aa  253  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.9 
 
 		 630 aa  253  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.52 
 
 		 728 aa  252  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.97 
 
 		 679 aa  251  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.25 
 
 		 592 aa  250  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.39 
 
 		 717 aa  250  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.56 
 
 		 642 aa  250  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.33 
 
 		 705 aa  250  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.7 
 
 		 864 aa  250  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.13 
 
 		 605 aa  250  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.72 
 
 		 612 aa  249  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.25 
 
 		 656 aa  249  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.96 
 
 		 646 aa  249  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.6 
 
 		 729 aa  248  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.19 
 
 		 681 aa  248  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  42.19 
 
 		 681 aa  248  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.27 
 
 		 646 aa  248  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.73 
 
 		 626 aa  247  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.98 
 
 		 729 aa  247  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.78 
 
 		 598 aa  246  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.8 
 
 		 714 aa  246  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  38.48 
 
 		 690 aa  245  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  34.44 
 
 		 608 aa  244  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.23 
 
 		 731 aa  244  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.37 
 
 		 681 aa  244  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  36.55 
 
 		 734 aa  244  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  36.64 
 
 		 608 aa  244  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  38.1 
 
 		 636 aa  244  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.47 
 
 		 731 aa  243  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.69 
 
 		 881 aa  243  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.27 
 
 		 709 aa  243  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0900  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.3 
 
 		 605 aa  242  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.05 
 
 		 602 aa  242  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  38.92 
 
 		 639 aa  242  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.94 
 
 		 642 aa  242  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.57 
 
 		 718 aa  241  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.44 
 
 		 716 aa  241  5.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.01 
 
 		 705 aa  241  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.76 
 
 		 737 aa  241  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.48 
 
 		 649 aa  241  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.01 
 
 		 705 aa  241  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.88 
 
 		 705 aa  241  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.5 
 
 		 679 aa  241  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.85 
 
 		 705 aa  240  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.54 
 
 		 725 aa  240  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.38 
 
 		 448 aa  240  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.73 
 
 		 790 aa  240  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.67 
 
 		 705 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.95 
 
 		 625 aa  240  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.22 
 
 		 705 aa  240  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  30.5 
 
 		 705 aa  239  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.85 
 
 		 590 aa  239  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.9 
 
 		 600 aa  239  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.13 
 
 		 607 aa  239  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.16 
 
 		 616 aa  239  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.77 
 
 		 725 aa  239  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.14 
 
 		 641 aa  239  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  30.5 
 
 		 705 aa  238  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.89 
 
 		 707 aa  238  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.38 
 
 		 653 aa  238  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.86 
 
 		 595 aa  238  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.19 
 
 		 606 aa  238  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1322  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.83 
 
 		 664 aa  238  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0577384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5409  ATP-dependent DNA helicase domain protein  38.22 
 
 		 642 aa  238  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.64 
 
 		 705 aa  237  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 		 593 aa  238  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.58 
 
 		 595 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.17 
 
 		 705 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  37.91 
 
 		 637 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.17 
 
 		 705 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 		 599 aa  236  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.08 
 
 		 736 aa  236  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.38 
 
 		 1376 aa  235  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.58 
 
 		 527 aa  235  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.79 
 
 		 710 aa  235  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.73 
 
 		 706 aa  235  7.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  38.02 
 
 		 669 aa  235  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>