More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28810 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.05 
 
 		 1469 aa  1192    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  69.84 
 
 		 1473 aa  2113    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0422166 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  40.68 
 
 		 1715 aa  1153    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28810  putative DNA helicase  100 
 
 		 1707 aa  3491    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0849671  decreased coverage  0.0000000181114 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.19 
 
 		 369 aa  271  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.44 
 
 		 716 aa  259  4e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.91 
 
 		 592 aa  256  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  33.14 
 
 		 690 aa  253  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  37.82 
 
 		 637 aa  249  3e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.23 
 
 		 593 aa  246  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.23 
 
 		 593 aa  246  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.01 
 
 		 606 aa  244  7.999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.72 
 
 		 594 aa  244  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.87 
 
 		 626 aa  244  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.69 
 
 		 598 aa  243  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.54 
 
 		 641 aa  242  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  38.16 
 
 		 654 aa  242  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.33 
 
 		 793 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.93 
 
 		 607 aa  241  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.61 
 
 		 607 aa  241  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.16 
 
 		 607 aa  241  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  39.31 
 
 		 679 aa  239  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.61 
 
 		 607 aa  239  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1455  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.69 
 
 		 651 aa  239  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.61 
 
 		 607 aa  239  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.05 
 
 		 607 aa  239  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2292  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.16 
 
 		 645 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114874  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.68 
 
 		 637 aa  239  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.44 
 
 		 646 aa  238  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.11 
 
 		 607 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.51 
 
 		 615 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1322  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.48 
 
 		 664 aa  237  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0577384  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.56 
 
 		 607 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2318  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  38.12 
 
 		 648 aa  236  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0019664  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.72 
 
 		 658 aa  236  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.72 
 
 		 665 aa  236  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.5 
 
 		 649 aa  235  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.11 
 
 		 607 aa  235  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  38.14 
 
 		 636 aa  234  7.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.92 
 
 		 602 aa  234  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1999  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.72 
 
 		 658 aa  235  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.06 
 
 		 607 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.38 
 
 		 642 aa  234  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.38 
 
 		 617 aa  234  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.34 
 
 		 724 aa  234  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.34 
 
 		 721 aa  234  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.28 
 
 		 607 aa  234  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.4 
 
 		 864 aa  234  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5409  ATP-dependent DNA helicase domain protein  41.5 
 
 		 642 aa  233  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274257  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.09 
 
 		 729 aa  233  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  38.92 
 
 		 637 aa  233  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  39.04 
 
 		 734 aa  233  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.55 
 
 		 641 aa  233  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.47 
 
 		 646 aa  234  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.79 
 
 		 592 aa  232  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.63 
 
 		 714 aa  232  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  38.36 
 
 		 597 aa  232  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.14 
 
 		 662 aa  232  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 		 674 aa  231  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  39.78 
 
 		 615 aa  230  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 		 656 aa  231  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  38.64 
 
 		 641 aa  230  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.35 
 
 		 642 aa  230  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.67 
 
 		 642 aa  230  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.98 
 
 		 634 aa  229  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.85 
 
 		 662 aa  229  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.85 
 
 		 662 aa  229  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.2 
 
 		 607 aa  229  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.54 
 
 		 605 aa  229  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.38 
 
 		 708 aa  228  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.23 
 
 		 679 aa  228  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.48 
 
 		 681 aa  228  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.44 
 
 		 705 aa  228  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.87 
 
 		 647 aa  228  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  40.73 
 
 		 681 aa  227  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.39 
 
 		 608 aa  227  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.73 
 
 		 681 aa  227  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.85 
 
 		 662 aa  228  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.22 
 
 		 634 aa  228  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  37.75 
 
 		 639 aa  227  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.95 
 
 		 707 aa  226  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.59 
 
 		 617 aa  226  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.38 
 
 		 613 aa  226  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.92 
 
 		 731 aa  225  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 		 612 aa  225  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.1 
 
 		 630 aa  225  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.34 
 
 		 451 aa  224  9e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.99 
 
 		 705 aa  224  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.21 
 
 		 588 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41 
 
 		 790 aa  224  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.16 
 
 		 659 aa  224  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.99 
 
 		 705 aa  224  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.45 
 
 		 681 aa  224  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.06 
 
 		 619 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.36 
 
 		 728 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.83 
 
 		 625 aa  223  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.55 
 
 		 626 aa  223  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.13 
 
 		 606 aa  223  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.09 
 
 		 610 aa  223  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  37.22 
 
 		 724 aa  222  3.9999999999999997e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>