More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0474 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  100 
 
 		 1469 aa  2975    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.35 
 
 		 1473 aa  1177    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0422166 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  54.29 
 
 		 1715 aa  1560    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28810  putative DNA helicase  46.12 
 
 		 1707 aa  1202    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0849671  decreased coverage  0.0000000181114 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.93 
 
 		 369 aa  320  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.66 
 
 		 626 aa  259  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.02 
 
 		 724 aa  258  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.02 
 
 		 721 aa  258  8e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.93 
 
 		 602 aa  256  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.85 
 
 		 563 aa  254  7e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.56 
 
 		 637 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 		 606 aa  252  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1322  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.59 
 
 		 664 aa  252  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0577384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.34 
 
 		 606 aa  251  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.6 
 
 		 731 aa  251  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.61 
 
 		 592 aa  250  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  43.5 
 
 		 639 aa  250  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.7 
 
 		 864 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.79 
 
 		 641 aa  249  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.99 
 
 		 451 aa  250  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.78 
 
 		 634 aa  248  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  38.72 
 
 		 690 aa  247  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  38.89 
 
 		 724 aa  247  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  36.78 
 
 		 734 aa  247  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.83 
 
 		 634 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.02 
 
 		 630 aa  246  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.38 
 
 		 590 aa  245  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.74 
 
 		 607 aa  243  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 		 681 aa  244  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.67 
 
 		 674 aa  243  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.78 
 
 		 593 aa  242  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.78 
 
 		 593 aa  242  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.59 
 
 		 656 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.78 
 
 		 793 aa  242  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.9 
 
 		 642 aa  242  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.44 
 
 		 716 aa  242  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.56 
 
 		 707 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  40.16 
 
 		 493 aa  241  8e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.38 
 
 		 705 aa  241  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  40.51 
 
 		 641 aa  240  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.34 
 
 		 592 aa  240  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.43 
 
 		 662 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.97 
 
 		 647 aa  241  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.19 
 
 		 598 aa  240  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.71 
 
 		 594 aa  239  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  39.03 
 
 		 679 aa  239  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  38.57 
 
 		 654 aa  239  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.32 
 
 		 729 aa  239  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.44 
 
 		 736 aa  239  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  38.29 
 
 		 608 aa  239  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.14 
 
 		 662 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.05 
 
 		 617 aa  238  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  39.88 
 
 		 669 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.05 
 
 		 646 aa  238  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.81 
 
 		 737 aa  238  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.51 
 
 		 642 aa  238  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.67 
 
 		 603 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.75 
 
 		 626 aa  237  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1455  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.27 
 
 		 651 aa  237  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.44 
 
 		 649 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.15 
 
 		 718 aa  237  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.63 
 
 		 588 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.89 
 
 		 679 aa  237  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.8 
 
 		 665 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  38.38 
 
 		 636 aa  236  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  38.29 
 
 		 608 aa  236  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 		 642 aa  237  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.14 
 
 		 662 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  40.67 
 
 		 615 aa  236  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.09 
 
 		 717 aa  236  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.17 
 
 		 658 aa  236  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.68 
 
 		 605 aa  235  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.75 
 
 		 646 aa  235  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.9 
 
 		 709 aa  234  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1895  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.29 
 
 		 633 aa  234  8.000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.45 
 
 		 608 aa  234  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.78 
 
 		 653 aa  234  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.57 
 
 		 662 aa  234  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 		 679 aa  234  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09613  ATP-dependent DNA helicase recQ  36.39 
 
 		 632 aa  234  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1999  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.75 
 
 		 658 aa  234  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.32 
 
 		 659 aa  233  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2292  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.89 
 
 		 645 aa  233  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114874  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.36 
 
 		 617 aa  232  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.84 
 
 		 715 aa  232  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5409  ATP-dependent DNA helicase domain protein  38.61 
 
 		 642 aa  232  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.18 
 
 		 601 aa  232  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.5 
 
 		 419 aa  232  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.18 
 
 		 608 aa  232  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.99 
 
 		 707 aa  231  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  39.28 
 
 		 597 aa  232  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.57 
 
 		 641 aa  231  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.07 
 
 		 1376 aa  231  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.72 
 
 		 609 aa  231  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.39 
 
 		 599 aa  231  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.69 
 
 		 615 aa  231  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  40.81 
 
 		 621 aa  230  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.46 
 
 		 714 aa  231  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.16 
 
 		 731 aa  230  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.49 
 
 		 728 aa  231  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>