More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1758 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1244 aa  2484    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  51.06 
 
 		 1174 aa  859    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  68.93 
 
 		 1127 aa  1250    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  42.23 
 
 		 1050 aa  602  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  37.33 
 
 		 1232 aa  541  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  60.81 
 
 		 1033 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  65.05 
 
 		 1089 aa  526  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  61.28 
 
 		 1027 aa  510  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  59.82 
 
 		 1078 aa  496  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  58.59 
 
 		 1075 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  58.63 
 
 		 1032 aa  482  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  58.37 
 
 		 1089 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  58.35 
 
 		 1001 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  54.27 
 
 		 1132 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  59.29 
 
 		 446 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  53.07 
 
 		 1161 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  55.84 
 
 		 1124 aa  458  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  56.13 
 
 		 1156 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  53.68 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  59.2 
 
 		 1082 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  49.52 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  53.88 
 
 		 1062 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  52.04 
 
 		 408 aa  422  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  54.23 
 
 		 1067 aa  413  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  48.45 
 
 		 411 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  48.93 
 
 		 411 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  41.84 
 
 		 414 aa  356  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  30.06 
 
 		 787 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.23 
 
 		 729 aa  200  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 		 681 aa  197  7e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  29.13 
 
 		 726 aa  195  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  29.76 
 
 		 739 aa  191  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  25.8 
 
 		 757 aa  192  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  31.32 
 
 		 457 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  28.88 
 
 		 744 aa  190  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  29.24 
 
 		 685 aa  189  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.4 
 
 		 670 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.82 
 
 		 858 aa  185  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.21 
 
 		 737 aa  184  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0360  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.14 
 
 		 671 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.69251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  26.99 
 
 		 779 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.86 
 
 		 685 aa  180  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  29.04 
 
 		 732 aa  179  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0428  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.67 
 
 		 670 aa  179  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  29.04 
 
 		 731 aa  179  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3599  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.18 
 
 		 670 aa  178  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  23.96 
 
 		 687 aa  178  6e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  30.07 
 
 		 409 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0374  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.36 
 
 		 671 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.16 
 
 		 673 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  27.27 
 
 		 671 aa  176  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.46 
 
 		 674 aa  175  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0376  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.46 
 
 		 671 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.158989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.26 
 
 		 766 aa  174  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.96 
 
 		 671 aa  174  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.33 
 
 		 685 aa  174  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.86 
 
 		 742 aa  174  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3650  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.46 
 
 		 671 aa  174  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3990  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.41 
 
 		 670 aa  174  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3266  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.42 
 
 		 670 aa  173  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4325  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.46 
 
 		 671 aa  173  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4012  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.26 
 
 		 670 aa  173  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0406  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.86 
 
 		 670 aa  173  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3913  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.26 
 
 		 670 aa  173  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.66 
 
 		 759 aa  171  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4147  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.05 
 
 		 670 aa  171  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0515139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  32.35 
 
 		 372 aa  171  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0305  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.7 
 
 		 670 aa  171  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  26.78 
 
 		 679 aa  170  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.38 
 
 		 677 aa  169  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.37 
 
 		 675 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.02 
 
 		 707 aa  169  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  31.18 
 
 		 401 aa  169  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.06 
 
 		 756 aa  168  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  26.23 
 
 		 677 aa  168  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.67 
 
 		 786 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.89 
 
 		 876 aa  165  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  28.95 
 
 		 394 aa  164  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  28.61 
 
 		 394 aa  164  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.2 
 
 		 674 aa  163  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.25 
 
 		 707 aa  163  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.2 
 
 		 674 aa  163  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.17 
 
 		 671 aa  163  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 757 aa  163  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.2 
 
 		 674 aa  163  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  28.73 
 
 		 659 aa  162  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.79 
 
 		 674 aa  162  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  26.86 
 
 		 825 aa  162  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  25.86 
 
 		 770 aa  161  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  26.46 
 
 		 716 aa  161  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  27.32 
 
 		 826 aa  159  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.6 
 
 		 857 aa  159  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  27.36 
 
 		 709 aa  159  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.13 
 
 		 674 aa  159  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  23.63 
 
 		 659 aa  158  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 		 732 aa  157  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  28.61 
 
 		 394 aa  156  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  27.16 
 
 		 393 aa  157  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 		 688 aa  156  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.09 
 
 		 694 aa  152  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>