More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06510 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC06510  ATP-dependent DNA helicase pcra, putative  100 
 
 		 982 aa  2030    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03797  DNA helicase and DNA-dependent ATPase (Eurofung)  41.09 
 
 		 997 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.99 
 
 		 785 aa  343  9e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.62 
 
 		 732 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.62 
 
 		 755 aa  342  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.76 
 
 		 725 aa  341  5e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.31 
 
 		 718 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  40.15 
 
 		 759 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.56 
 
 		 772 aa  337  5e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.22 
 
 		 747 aa  335  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.58 
 
 		 741 aa  334  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.07 
 
 		 738 aa  334  5e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  38.22 
 
 		 751 aa  334  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.22 
 
 		 747 aa  334  5e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  38.22 
 
 		 753 aa  334  6e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.22 
 
 		 751 aa  334  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.22 
 
 		 751 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.8 
 
 		 802 aa  333  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.22 
 
 		 751 aa  333  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  36.65 
 
 		 738 aa  333  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.19 
 
 		 753 aa  333  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  38.88 
 
 		 739 aa  332  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.92 
 
 		 715 aa  332  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.42 
 
 		 747 aa  332  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  37.03 
 
 		 787 aa  332  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.01 
 
 		 753 aa  332  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  37.8 
 
 		 746 aa  331  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.52 
 
 		 730 aa  330  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.52 
 
 		 730 aa  330  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  38.28 
 
 		 742 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  37.64 
 
 		 736 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  38.88 
 
 		 707 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.23 
 
 		 751 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  36.02 
 
 		 738 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.7 
 
 		 766 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.79 
 
 		 831 aa  329  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.5 
 
 		 817 aa  328  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.23 
 
 		 751 aa  328  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  37.02 
 
 		 845 aa  328  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.64 
 
 		 932 aa  328  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.51 
 
 		 763 aa  327  5e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.83 
 
 		 773 aa  327  9e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  38.43 
 
 		 735 aa  326  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  43.75 
 
 		 737 aa  324  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  37.85 
 
 		 768 aa  324  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  34.96 
 
 		 638 aa  323  7e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.55 
 
 		 768 aa  323  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  36.5 
 
 		 678 aa  323  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  38.98 
 
 		 728 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.2 
 
 		 741 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  32.97 
 
 		 804 aa  322  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  38.98 
 
 		 728 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.94 
 
 		 729 aa  322  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  37.64 
 
 		 728 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  38.39 
 
 		 727 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  37.64 
 
 		 728 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  40.84 
 
 		 786 aa  320  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  35.54 
 
 		 758 aa  320  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  40.84 
 
 		 783 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  36.38 
 
 		 770 aa  320  9e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.14 
 
 		 729 aa  320  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.32 
 
 		 737 aa  320  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  37.59 
 
 		 779 aa  319  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.31 
 
 		 768 aa  319  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  34.49 
 
 		 639 aa  318  2e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.67 
 
 		 1023 aa  318  3e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  35.07 
 
 		 817 aa  318  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  35.49 
 
 		 783 aa  318  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.82 
 
 		 756 aa  318  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  35.99 
 
 		 807 aa  317  5e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  37.45 
 
 		 728 aa  318  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  38.13 
 
 		 729 aa  318  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  36.82 
 
 		 743 aa  316  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  37.41 
 
 		 735 aa  316  9.999999999999999e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  37.08 
 
 		 735 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.64 
 
 		 841 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.64 
 
 		 742 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  38.39 
 
 		 751 aa  316  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2436  UvrD/REP helicase  35.12 
 
 		 778 aa  315  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0016628  normal  0.650689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.46 
 
 		 786 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  34.19 
 
 		 825 aa  313  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  34.52 
 
 		 826 aa  312  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.19 
 
 		 857 aa  312  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  37.83 
 
 		 726 aa  312  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  38.25 
 
 		 757 aa  312  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  34.85 
 
 		 770 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  37.04 
 
 		 720 aa  311  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.34 
 
 		 817 aa  311  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  37.04 
 
 		 720 aa  311  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  37.24 
 
 		 731 aa  311  5e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  37.04 
 
 		 720 aa  311  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  37.04 
 
 		 720 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  37.04 
 
 		 720 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  37.04 
 
 		 720 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  37.04 
 
 		 720 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  37.04 
 
 		 720 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.25 
 
 		 711 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  36.92 
 
 		 727 aa  310  9e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.45 
 
 		 759 aa  310  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.11 
 
 		 781 aa  310  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>