289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0942 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0942  putative lipoprotein  100 
 
 
428 aa  884    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0813941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0826  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  93.46 
 
 
428 aa  803    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_813  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  94.86 
 
 
428 aa  816    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0943  putative lipoprotein  71.11 
 
 
430 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0827  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  70.86 
 
 
430 aa  600  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_814  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  70.37 
 
 
430 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.888026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 
394 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2285  Extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
385 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.399222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0626  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.61 
 
 
410 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741534  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0542  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.81 
 
 
420 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2427  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.6 
 
 
403 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1546  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.55 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.04 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.09 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  26 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  21.06 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  23.82 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0139  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  23.53 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4575  ABC transporter substrate-binding protein  22.02 
 
 
426 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
380 aa  67  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 
371 aa  67  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7952  Extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4179  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  21.77 
 
 
438 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2361  extracellular ligand-binding receptor  21.29 
 
 
383 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00517611  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.62 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1566  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  21.9 
 
 
426 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  23.93 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000400  ABC transporter substrate-binding protein  23.39 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  24.49 
 
 
389 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7080  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  22.46 
 
 
404 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 
400 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.15 
 
 
395 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4614  extracellular ligand-binding receptor  24.3 
 
 
406 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2607  putative branched-chain amino acid ABC transporter  21.33 
 
 
414 aa  63.2  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1556  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  20.39 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4650  putative ABC transporter (substrate-binding protein); putative branched-chain amino acid transporter  21.91 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  21.71 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  24.63 
 
 
373 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  21.9 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7651  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.99 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99279  normal  0.165016 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  23.2 
 
 
381 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  21.67 
 
 
394 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4000  Extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 
403 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0038  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  22.11 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0121  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1864  branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  23.26 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.397842  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  22.96 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0352  extracellular ligand-binding receptor  21.98 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
383 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  23.99 
 
 
410 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 
410 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 
379 aa  57  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  25.51 
 
 
383 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 
376 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  22.34 
 
 
385 aa  56.6  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  22.99 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.18 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3133  putative branched-chain amino acid ABC transporter  21.88 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.401616  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2357  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0768636  normal  0.579443 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  23.69 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3506  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  21.98 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2379  Extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0718  Extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  22.69 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.43 
 
 
396 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  22.46 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.41 
 
 
371 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  22.26 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  22.6 
 
 
406 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 
374 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  21.9 
 
 
386 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0752  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 
405 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284007  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  23.18 
 
 
397 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.31 
 
 
388 aa  53.9  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  23.99 
 
 
414 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>