More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1409 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1409  membrane-fusion protein-like  100 
 
 		 312 aa  638    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2200  secretion protein HlyD family protein  31.71 
 
 		 274 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.353788  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.27 
 
 		 397 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  27.16 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  27.39 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  26.56 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  29.46 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  25.4 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0520  secretion protein HlyD  24.43 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1680  RND family efflux transporter MFP subunit  23.4 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.560813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  24.81 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.99 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  22.34 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  22.29 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.5 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  24.9 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  26.07 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.95 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3513  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.14 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  23.65 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  24.9 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2356  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3735  RND family efflux transporter MFP subunit  23.33 
 
 		 410 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2342  secretion protein HlyD  25.97 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4015  hypothetical protein  24.51 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  27.19 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.65 
 
 		 383 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  23.33 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1570  RND family efflux transporter MFP subunit  28.77 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.628485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0650  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.13 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0627  RND family efflux transporter MFP subunit  23 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  30.93 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  21.65 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  23.88 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  23.39 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3112  RND family efflux transporter MFP subunit  30.37 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2987  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.331807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1390  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.75 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  22.27 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  22.96 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  27.12 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_002978  WD0345  RND family efflux transporter MFP subunit  21.12 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0426386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  25.67 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  23.89 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  23.81 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3234  hypothetical protein  22.86 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475662  normal  0.284484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1278  secretion protein HlyD  26.23 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0363804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  24.31 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2973  RND family efflux transporter MFP subunit  24.03 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.388324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.1 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  23.14 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  28.7 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  24.48 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0059  RND family efflux transporter MFP subunit  24.19 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  25.1 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  24.22 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  24.75 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  25.4 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.09 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3131  RND family efflux transporter MFP subunit  24.03 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.419387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.42 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  24.07 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  24.81 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3255  RND family efflux transporter MFP subunit  23.05 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  24.67 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 376 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  25.52 
 
 		 476 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  28.02 
 
 		 363 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  24.02 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.02 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  23.98 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.19 
 
 		 407 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  24.02 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0868  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  24.23 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.5 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  25.28 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  28.57 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  24.41 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  25 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  25.52 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.02 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.85 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.5 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  24.64 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.46 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  33.63 
 
 		 621 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.79 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.5 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>