103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0721 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  690    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  55.76 
 
 
341 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  51.45 
 
 
355 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  51.34 
 
 
358 aa  345  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  49.41 
 
 
356 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  50.74 
 
 
364 aa  338  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  48.83 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  50.6 
 
 
351 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  49.85 
 
 
365 aa  328  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  49.11 
 
 
369 aa  326  3e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  51.17 
 
 
364 aa  326  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  48.67 
 
 
342 aa  317  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  49.04 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  45.65 
 
 
347 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  41.76 
 
 
357 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  46.31 
 
 
344 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  55.79 
 
 
245 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  39.51 
 
 
360 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  38.77 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  34.48 
 
 
354 aa  209  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  33.53 
 
 
367 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  35.24 
 
 
339 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  37.5 
 
 
358 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  33.24 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  34.75 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  33.24 
 
 
387 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  33.23 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  33.23 
 
 
361 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  33.24 
 
 
388 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  35.24 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  35.24 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  35.24 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  37.8 
 
 
347 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  33.96 
 
 
349 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  38.01 
 
 
364 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  32.94 
 
 
367 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  35.46 
 
 
350 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  34.48 
 
 
335 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  36.25 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  37.07 
 
 
339 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  33.13 
 
 
349 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  33.97 
 
 
341 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  36.99 
 
 
345 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  33.23 
 
 
345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  39.11 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  38.24 
 
 
348 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  34.04 
 
 
335 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  35.11 
 
 
354 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  31.52 
 
 
375 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  34.19 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  36.62 
 
 
353 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  30.95 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  32 
 
 
375 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  35.92 
 
 
353 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  33.04 
 
 
344 aa  169  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  30.64 
 
 
368 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  36.84 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  31.89 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  34.88 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  32 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  32.01 
 
 
359 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  36.36 
 
 
345 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  32.01 
 
 
389 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  31.11 
 
 
407 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  35.4 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  32.92 
 
 
342 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  30.46 
 
 
357 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  31.68 
 
 
376 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  32.6 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  40.27 
 
 
400 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  32.52 
 
 
333 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  30.42 
 
 
370 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  33.21 
 
 
361 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  33.14 
 
 
371 aa  152  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  30.84 
 
 
382 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  30.16 
 
 
387 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  30.49 
 
 
384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  32.9 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  30.41 
 
 
343 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  29.63 
 
 
381 aa  145  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  31.56 
 
 
360 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  33.45 
 
 
349 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  30.74 
 
 
359 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  37.02 
 
 
381 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  30 
 
 
361 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  39.06 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  44.9 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  29.71 
 
 
351 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  29.55 
 
 
353 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  34.22 
 
 
378 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  31.82 
 
 
232 aa  92.8  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  31.48 
 
 
217 aa  90.9  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  29.23 
 
 
393 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  25 
 
 
171 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  31.31 
 
 
235 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0178  hypothetical protein  39.62 
 
 
56 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  25.56 
 
 
159 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  25.56 
 
 
159 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  25.56 
 
 
159 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  28.71 
 
 
150 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>