59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2121 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 		 150 aa  315  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  49.06 
 
 		 387 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  53.92 
 
 		 358 aa  117  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  41.77 
 
 		 382 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  49.02 
 
 		 347 aa  105  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  38.76 
 
 		 359 aa  103  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  42.86 
 
 		 358 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  47.47 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  46.08 
 
 		 345 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  43.64 
 
 		 381 aa  99.4  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  44.12 
 
 		 348 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  37.76 
 
 		 368 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  40.87 
 
 		 347 aa  97.1  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  45.1 
 
 		 381 aa  97.1  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  44.12 
 
 		 342 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  44.12 
 
 		 368 aa  91.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  42.86 
 
 		 343 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  36.51 
 
 		 354 aa  89.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  44.79 
 
 		 361 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  40.2 
 
 		 343 aa  87  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  45.1 
 
 		 350 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  43.36 
 
 		 357 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  36.51 
 
 		 393 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  42.27 
 
 		 264 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  38.61 
 
 		 364 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  32.54 
 
 		 339 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  37.62 
 
 		 353 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  38.61 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  36.46 
 
 		 351 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  30.95 
 
 		 345 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  35.64 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  35.29 
 
 		 232 aa  67  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  31.75 
 
 		 344 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  34.51 
 
 		 353 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  30.93 
 
 		 350 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  31.03 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  34.38 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  28.46 
 
 		 367 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  30.43 
 
 		 378 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  30.43 
 
 		 378 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  30.43 
 
 		 378 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  27.64 
 
 		 367 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  27.64 
 
 		 367 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  27.64 
 
 		 361 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  34.31 
 
 		 387 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  34.31 
 
 		 387 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  33.66 
 
 		 341 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  30.69 
 
 		 388 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  27.7 
 
 		 389 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  28.71 
 
 		 337 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  26.11 
 
 		 358 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  27.59 
 
 		 355 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  24.62 
 
 		 349 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  31.07 
 
 		 407 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  29.51 
 
 		 357 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  24.41 
 
 		 375 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  28.35 
 
 		 245 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  27.88 
 
 		 350 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  25 
 
 		 353 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>