105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0379 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  709    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  55.03 
 
 
345 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  54.9 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  51.95 
 
 
353 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  52.87 
 
 
353 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  53.61 
 
 
354 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  44.38 
 
 
358 aa  311  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  41.92 
 
 
358 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  41.28 
 
 
347 aa  291  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  41.29 
 
 
361 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  39.58 
 
 
342 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  38.38 
 
 
368 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  39.88 
 
 
347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  38.78 
 
 
381 aa  273  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  37.31 
 
 
343 aa  267  2e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  37.15 
 
 
354 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  38.46 
 
 
360 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  35.29 
 
 
387 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  36.34 
 
 
348 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  37.08 
 
 
345 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  34.58 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  39.94 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  36.76 
 
 
359 aa  249  4e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  37.35 
 
 
338 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  51.36 
 
 
232 aa  242  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  34.33 
 
 
361 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  40.34 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  36.45 
 
 
343 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  34.32 
 
 
382 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  36.78 
 
 
349 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  35.65 
 
 
350 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  32.83 
 
 
364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  37.07 
 
 
360 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  35.71 
 
 
339 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  35.14 
 
 
350 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  31.55 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  32.37 
 
 
351 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  33.13 
 
 
353 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  37.82 
 
 
264 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  31.07 
 
 
378 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  30.79 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  30.79 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  30.12 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  30.99 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  30.88 
 
 
364 aa  172  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  29.71 
 
 
389 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  30.23 
 
 
353 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  31.25 
 
 
345 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  28.9 
 
 
349 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  33.04 
 
 
337 aa  169  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  29.35 
 
 
388 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  30.7 
 
 
365 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  32.72 
 
 
351 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  28.97 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  33.67 
 
 
358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  32.41 
 
 
369 aa  165  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  31.49 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  27.65 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  30.85 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  30.88 
 
 
342 aa  162  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  28.35 
 
 
361 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  28.35 
 
 
367 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  29.89 
 
 
387 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  31.14 
 
 
364 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  29.61 
 
 
387 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  26.65 
 
 
375 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  30.75 
 
 
347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  31.19 
 
 
323 aa  153  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  27.03 
 
 
375 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  27.2 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  29.28 
 
 
335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  29.11 
 
 
350 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  28.44 
 
 
340 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  27.38 
 
 
341 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  31.21 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  27.54 
 
 
357 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  29.3 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  26.04 
 
 
359 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  30.25 
 
 
393 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  35.02 
 
 
245 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  27.33 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  37.82 
 
 
160 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  26.78 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  23.92 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  24.11 
 
 
375 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  25.07 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  24.8 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  27.38 
 
 
333 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  25.56 
 
 
387 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  27.02 
 
 
400 aa  99.8  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  22.57 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  25.27 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  37.19 
 
 
171 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  30.86 
 
 
199 aa  92.4  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  35.66 
 
 
167 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  46.51 
 
 
154 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2446  protein of unknown function DUF1016  27.74 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  31.75 
 
 
150 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  22.3 
 
 
178 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  23.81 
 
 
217 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>