101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3741 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 
323 aa  655    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  69.45 
 
 
356 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  70.06 
 
 
358 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  69.72 
 
 
355 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  62.22 
 
 
364 aa  411  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  59.74 
 
 
351 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  76.47 
 
 
245 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  57.05 
 
 
364 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  53.67 
 
 
353 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  55.95 
 
 
369 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  55.41 
 
 
365 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  54.37 
 
 
357 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  57.83 
 
 
344 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  52.72 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  50.96 
 
 
342 aa  342  5e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  49.04 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  47.28 
 
 
341 aa  285  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  39.12 
 
 
354 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  37.42 
 
 
335 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  38.34 
 
 
339 aa  209  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  36.94 
 
 
389 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  36.86 
 
 
387 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  36.86 
 
 
387 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  36.65 
 
 
378 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  36.65 
 
 
378 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  36.65 
 
 
378 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  35.8 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  36.42 
 
 
361 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  36.42 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  37.12 
 
 
350 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  35.8 
 
 
367 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  36.42 
 
 
367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  37.46 
 
 
345 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  38.44 
 
 
341 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  36.16 
 
 
349 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  38.12 
 
 
358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  36.79 
 
 
358 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  35.86 
 
 
370 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  36.51 
 
 
347 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  32.73 
 
 
375 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  35.18 
 
 
338 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  35.17 
 
 
376 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  36.25 
 
 
347 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  36.25 
 
 
353 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  36.33 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  36.22 
 
 
349 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  35.62 
 
 
353 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  32.66 
 
 
371 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  32.73 
 
 
375 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  34.43 
 
 
339 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  36.39 
 
 
348 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  33.33 
 
 
384 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  33.91 
 
 
389 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  32.84 
 
 
375 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  32.03 
 
 
340 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  36.6 
 
 
359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  33.86 
 
 
345 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  34.73 
 
 
335 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  37.09 
 
 
354 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  32.81 
 
 
345 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  29.89 
 
 
407 aa  162  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  34.9 
 
 
349 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  34.18 
 
 
354 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  31.56 
 
 
342 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  33.54 
 
 
333 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  32.04 
 
 
360 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  34.85 
 
 
364 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  38.66 
 
 
400 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  35.16 
 
 
387 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  33.23 
 
 
350 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  33.9 
 
 
368 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  31.19 
 
 
344 aa  153  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  32.71 
 
 
360 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  34.62 
 
 
361 aa  149  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  28.92 
 
 
387 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  31.61 
 
 
357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  34.78 
 
 
343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  31.09 
 
 
343 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  29.75 
 
 
368 aa  142  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  28.53 
 
 
381 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  34.07 
 
 
350 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  30.55 
 
 
382 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  29.97 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  32.32 
 
 
351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  28.21 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  32.37 
 
 
378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  33.56 
 
 
353 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  29.77 
 
 
264 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  27.24 
 
 
359 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  41.5 
 
 
160 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  35.36 
 
 
217 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  32.46 
 
 
393 aa  96.3  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  30.24 
 
 
232 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  27.62 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  40.85 
 
 
159 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  40.85 
 
 
159 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  40.85 
 
 
159 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  40.85 
 
 
136 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  31.37 
 
 
171 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0178  hypothetical protein  45.65 
 
 
56 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>