32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0178 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0178  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  56.6 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  50.94 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  45.45 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  47.27 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  50.94 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  47.27 
 
 		 347 aa  58.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  50.94 
 
 		 355 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  48.08 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  57.45 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  47.17 
 
 		 356 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  43.64 
 
 		 365 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  39.62 
 
 		 337 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  45.65 
 
 		 323 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  46.15 
 
 		 232 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  43.4 
 
 		 358 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  49.06 
 
 		 347 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  47.17 
 
 		 347 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  39.53 
 
 		 364 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  41.82 
 
 		 354 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  42.86 
 
 		 389 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  41.18 
 
 		 341 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  40 
 
 		 339 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  44.9 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  42.86 
 
 		 345 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  45.28 
 
 		 354 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  40 
 
 		 335 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  40.38 
 
 		 350 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  46.15 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  39.58 
 
 		 357 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  38.33 
 
 		 350 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>