110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0706 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 
389 aa  801    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  56.64 
 
 
407 aa  451  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  51.66 
 
 
333 aa  331  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  46.07 
 
 
375 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  44.25 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  47.16 
 
 
350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  42.38 
 
 
359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  43.78 
 
 
339 aa  285  8e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  42.78 
 
 
389 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  41.16 
 
 
340 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  43.43 
 
 
387 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  41.44 
 
 
387 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  41.76 
 
 
387 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  38.29 
 
 
345 aa  266  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  41.21 
 
 
388 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  39.67 
 
 
375 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  40.33 
 
 
400 aa  262  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  39.3 
 
 
367 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  39.04 
 
 
361 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  39.04 
 
 
367 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  39.5 
 
 
378 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  39.5 
 
 
378 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  39.24 
 
 
378 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  38.57 
 
 
349 aa  253  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  38.52 
 
 
367 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  37.12 
 
 
335 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  39.12 
 
 
375 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  38.73 
 
 
349 aa  243  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  37.71 
 
 
370 aa  236  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  40.06 
 
 
341 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  35.67 
 
 
384 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  35.44 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  35.82 
 
 
371 aa  216  7e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  32.78 
 
 
378 aa  202  8e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  34.28 
 
 
342 aa  186  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  32.28 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  33.16 
 
 
364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  35.05 
 
 
364 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  33.33 
 
 
351 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  32.49 
 
 
356 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  32.3 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  32.96 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  32.27 
 
 
355 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  32.27 
 
 
347 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  32.61 
 
 
364 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  32.51 
 
 
353 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  33.91 
 
 
323 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  33.99 
 
 
358 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  30.16 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  32.34 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  32.29 
 
 
358 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  32.01 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  30.09 
 
 
381 aa  162  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  30.7 
 
 
358 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  30.18 
 
 
387 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  29.97 
 
 
345 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  30.59 
 
 
348 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  30 
 
 
347 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  30.77 
 
 
361 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  31.13 
 
 
360 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  29.22 
 
 
342 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  29.66 
 
 
343 aa  156  7e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  29.67 
 
 
341 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  27.86 
 
 
338 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  29.3 
 
 
381 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  30.83 
 
 
347 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  30.23 
 
 
350 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  30.37 
 
 
357 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  28.41 
 
 
368 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  30.81 
 
 
357 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  27.2 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  26.89 
 
 
345 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  27.05 
 
 
360 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  34.02 
 
 
344 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  29.78 
 
 
339 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  28.49 
 
 
359 aa  145  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  27.66 
 
 
349 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  28.37 
 
 
361 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  36.4 
 
 
245 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  28.95 
 
 
350 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  28.23 
 
 
353 aa  136  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  27.61 
 
 
335 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  26.91 
 
 
343 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  26.49 
 
 
339 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  27.44 
 
 
353 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  34.58 
 
 
264 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  29.14 
 
 
354 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  26.61 
 
 
351 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  32.35 
 
 
217 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  26.22 
 
 
353 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  27.78 
 
 
393 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  42.74 
 
 
159 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  42.74 
 
 
159 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  42.74 
 
 
159 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  44.95 
 
 
136 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  32.67 
 
 
160 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  30.37 
 
 
235 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  27.2 
 
 
232 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  42.67 
 
 
71 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1901  hypothetical protein  44.71 
 
 
92 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.95384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>