109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3692 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  92.5 
 
 		 367 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  98.89 
 
 		 367 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  99.72 
 
 		 367 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  78.39 
 
 		 375 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  80.52 
 
 		 349 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  78.49 
 
 		 375 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  58.89 
 
 		 389 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  58.79 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  60.17 
 
 		 378 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  59 
 
 		 387 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  60.17 
 
 		 378 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  60.17 
 
 		 378 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  58.01 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  61.83 
 
 		 341 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  38.92 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  41.8 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  41.56 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  38.87 
 
 		 340 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  40.12 
 
 		 335 aa  245  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  39.26 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  40.94 
 
 		 359 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  38.11 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  37.5 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  38.3 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  38.86 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  39.24 
 
 		 376 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  39.46 
 
 		 342 aa  222  7e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  38.05 
 
 		 369 aa  222  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  37.78 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  33.94 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  38.44 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  35.04 
 
 		 371 aa  209  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  36.95 
 
 		 351 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  34.36 
 
 		 353 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  35.68 
 
 		 384 aa  209  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  38.39 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  34.26 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  35.97 
 
 		 400 aa  205  9e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  36 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  33.23 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  35.38 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  36.42 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  35.95 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  34.95 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  35.15 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  33.05 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  33.76 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  34.74 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  34.71 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  35.28 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  33.02 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  32.95 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  32.54 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  32.22 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  31.98 
 
 		 368 aa  179  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  33.33 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  32.19 
 
 		 345 aa  176  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  31.9 
 
 		 360 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  35.03 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  32.71 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  69.29 
 
 		 136 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  31.9 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  69.29 
 
 		 159 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  69.29 
 
 		 159 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  69.29 
 
 		 159 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  31.63 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  33.44 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  32 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  34.69 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  32.5 
 
 		 345 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  32.24 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  29.34 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  32.5 
 
 		 353 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  33.55 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  32.92 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  30.42 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  29.94 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  28.35 
 
 		 344 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  29.97 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  31.87 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  32.27 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  30.61 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  37.61 
 
 		 245 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  31.02 
 
 		 350 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  29.13 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  32 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  27.6 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  42.57 
 
 		 217 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  28.88 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  29.94 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  34.01 
 
 		 264 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  28.84 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  27.5 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  39.73 
 
 		 160 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  31 
 
 		 232 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  33.79 
 
 		 235 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  29.09 
 
 		 393 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  58.9 
 
 		 71 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4863  hypothetical protein  56.92 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>