101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6259 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 
335 aa  694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  54.32 
 
 
360 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  52.31 
 
 
349 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  50.46 
 
 
338 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  51.27 
 
 
339 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  44.07 
 
 
353 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  44.07 
 
 
353 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  44.16 
 
 
354 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  41.12 
 
 
339 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  40.34 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  40.73 
 
 
345 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  39.26 
 
 
354 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  38.69 
 
 
358 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  37.79 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  37.13 
 
 
345 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  37.09 
 
 
342 aa  210  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  61.78 
 
 
160 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  39.53 
 
 
347 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  36.9 
 
 
356 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  36.86 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  32.75 
 
 
368 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  35.2 
 
 
348 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  35.06 
 
 
360 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  35.22 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  34.81 
 
 
361 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  37.16 
 
 
350 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  35.47 
 
 
357 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  37.04 
 
 
358 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  36.15 
 
 
361 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  35.58 
 
 
364 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  33.12 
 
 
359 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  36.12 
 
 
353 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  35.15 
 
 
345 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  34.07 
 
 
381 aa  186  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  35.19 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  32.43 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  34.04 
 
 
337 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  35.82 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  35.38 
 
 
349 aa  182  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  33.65 
 
 
343 aa  181  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  31.3 
 
 
387 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  34.38 
 
 
350 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  36.76 
 
 
351 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  34.31 
 
 
368 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  32.21 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  31.9 
 
 
361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  31.1 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  32.21 
 
 
367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  32.1 
 
 
341 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  32.52 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  32.92 
 
 
369 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  32.82 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  33.44 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  31.64 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  29.18 
 
 
382 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  32.62 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  34.73 
 
 
323 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  33.33 
 
 
357 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  31.94 
 
 
378 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  33.54 
 
 
365 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  32.08 
 
 
375 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  31.94 
 
 
378 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  31.94 
 
 
378 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  31.44 
 
 
335 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  32.37 
 
 
387 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  30.4 
 
 
354 aa  155  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  30.19 
 
 
350 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  31.58 
 
 
389 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  30.31 
 
 
339 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  30.72 
 
 
388 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  32.37 
 
 
387 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  31.15 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  31.08 
 
 
353 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  36.77 
 
 
344 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  36.32 
 
 
264 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  31.01 
 
 
375 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  31.27 
 
 
347 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  41.09 
 
 
232 aa  143  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  28.41 
 
 
378 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  27.61 
 
 
389 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  36.68 
 
 
245 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  38.92 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  29.06 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  29.43 
 
 
341 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  29.71 
 
 
376 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  30.52 
 
 
375 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  28.78 
 
 
370 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  34.63 
 
 
400 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  31.25 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  25 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  31.74 
 
 
393 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  27.1 
 
 
333 aa  102  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  32.59 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2446  protein of unknown function DUF1016  29.41 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  29.06 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  35 
 
 
120 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  27.01 
 
 
217 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  33.75 
 
 
154 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0744  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  25.18 
 
 
199 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>