52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2615 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  54.95 
 
 		 351 aa  97.1  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  56.96 
 
 		 393 aa  90.1  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  52.38 
 
 		 353 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  51.81 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  47.56 
 
 		 343 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  37.36 
 
 		 353 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  36.56 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  36.26 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  38.38 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  34.23 
 
 		 358 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  36.17 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  35 
 
 		 335 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  36.05 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  34.04 
 
 		 358 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  35.92 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  42.35 
 
 		 361 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  41.27 
 
 		 354 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  40 
 
 		 350 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  32.22 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  33.7 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  28.57 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  35.71 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  33.72 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  27.1 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  34.07 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  37.68 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  31.4 
 
 		 339 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  32.97 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  30.59 
 
 		 387 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  34.07 
 
 		 348 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  34.07 
 
 		 349 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  31.52 
 
 		 347 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  31.11 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  27.06 
 
 		 343 aa  51.6  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  31.11 
 
 		 381 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  29.79 
 
 		 357 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  27.08 
 
 		 359 aa  50.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  35.59 
 
 		 350 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  34.04 
 
 		 376 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  35.59 
 
 		 345 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  40.98 
 
 		 345 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  37.1 
 
 		 339 aa  47.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  31.67 
 
 		 382 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  35.48 
 
 		 335 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  36.07 
 
 		 359 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  39.39 
 
 		 384 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  34.25 
 
 		 371 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  34.43 
 
 		 407 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  31.4 
 
 		 337 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  27.16 
 
 		 381 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  32.2 
 
 		 354 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>