102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1578 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  96.6 
 
 		 353 aa  699    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 		 353 aa  723    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  86.16 
 
 		 354 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  63.75 
 
 		 339 aa  465  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  60.12 
 
 		 345 aa  434  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  52.87 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  46.43 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  46.79 
 
 		 347 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  44.55 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  43.47 
 
 		 347 aa  298  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  44.14 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  39.38 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  42.55 
 
 		 348 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  40 
 
 		 368 aa  285  9e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  41 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  40.42 
 
 		 342 aa  278  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  37.74 
 
 		 387 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  59.72 
 
 		 232 aa  266  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  45.17 
 
 		 361 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  38.92 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  39.94 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  41.32 
 
 		 360 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  39.88 
 
 		 364 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  38.34 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  35.87 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  44.78 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  42.86 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  40.62 
 
 		 368 aa  252  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  38.11 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  36.84 
 
 		 361 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  43.77 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  44.07 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  42.76 
 
 		 339 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  37.54 
 
 		 350 aa  232  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  33.43 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  35.67 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  38.35 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  44.74 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  35.71 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  36.84 
 
 		 355 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  35.48 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  36.57 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  34.02 
 
 		 364 aa  179  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  34.43 
 
 		 365 aa  175  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  32.44 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  34.55 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  34.89 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  35.62 
 
 		 323 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  33.03 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  35.92 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  34.25 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  34.25 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  35.26 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  35.26 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  35.26 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  31.14 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  33.44 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  32.88 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  33.03 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  34.15 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  32.19 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  33.13 
 
 		 335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  33.8 
 
 		 389 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  31.87 
 
 		 367 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  31.74 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  31.87 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  33.75 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  35 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  30.75 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  29.97 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  32.92 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  31.79 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  30.68 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  31.56 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  31.38 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  33.11 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  34.73 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  34.76 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  29.54 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  35.65 
 
 		 245 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  27.44 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  47.69 
 
 		 160 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  29.35 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  28.41 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  30.63 
 
 		 384 aa  119  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  25.45 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  27.63 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  27.02 
 
 		 375 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  37.06 
 
 		 167 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  38.89 
 
 		 171 aa  106  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  28.93 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  31.68 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  30 
 
 		 400 aa  99.8  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  32.75 
 
 		 199 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  44.05 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2446  protein of unknown function DUF1016  36.07 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  37.62 
 
 		 150 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  34.91 
 
 		 178 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  37.36 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>