102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1220 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  791    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  63.3 
 
 
371 aa  448  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  58.78 
 
 
376 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  55.59 
 
 
370 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  43.85 
 
 
378 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  38.78 
 
 
400 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  39.04 
 
 
387 aa  253  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  39.27 
 
 
375 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  37.67 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  37.6 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  36.53 
 
 
388 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  36.53 
 
 
387 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  36.53 
 
 
387 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  39.04 
 
 
389 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  37.57 
 
 
378 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  37.57 
 
 
378 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  37.81 
 
 
378 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  36.13 
 
 
354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  38.92 
 
 
341 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  35.67 
 
 
389 aa  219  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  34.81 
 
 
367 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  36.46 
 
 
367 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  36.2 
 
 
367 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  32.73 
 
 
407 aa  209  8e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  34.68 
 
 
335 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  35.68 
 
 
361 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  36.81 
 
 
359 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  33.6 
 
 
375 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  34.87 
 
 
345 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  34.08 
 
 
339 aa  200  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  33.86 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  34.86 
 
 
375 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  32.88 
 
 
350 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  33.79 
 
 
342 aa  180  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  33.52 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  40.74 
 
 
235 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  32.93 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  33.33 
 
 
323 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  32.96 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  36.65 
 
 
364 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  32.69 
 
 
355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  34.69 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  35.85 
 
 
365 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  32.09 
 
 
351 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  30.57 
 
 
353 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  31.14 
 
 
364 aa  158  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  39.19 
 
 
245 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  38.01 
 
 
350 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  31.75 
 
 
358 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  36.44 
 
 
347 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  31.47 
 
 
382 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  31.27 
 
 
342 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  30.49 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  33.53 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  35.75 
 
 
361 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  32.39 
 
 
368 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  29.95 
 
 
338 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  30.66 
 
 
347 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  36.43 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  31.99 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  29.14 
 
 
341 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  35.68 
 
 
345 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  28.45 
 
 
348 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  26.04 
 
 
357 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  37.04 
 
 
264 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  29.26 
 
 
339 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  34.73 
 
 
358 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  33.08 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  26.58 
 
 
387 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  30.03 
 
 
368 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  29.14 
 
 
381 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  28.72 
 
 
360 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  29.47 
 
 
359 aa  129  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  29.03 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  33.63 
 
 
360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  29.06 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  36.95 
 
 
381 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  29.19 
 
 
339 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  33.93 
 
 
349 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  28.85 
 
 
350 aa  123  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  31.04 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  26.69 
 
 
357 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  33.95 
 
 
343 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  30.63 
 
 
353 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  34.55 
 
 
354 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  26.47 
 
 
343 aa  114  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  24.8 
 
 
344 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  33.98 
 
 
345 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  30.36 
 
 
393 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  37.33 
 
 
160 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  31.1 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  34.32 
 
 
353 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  30.2 
 
 
217 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0058  hypothetical protein  61.19 
 
 
119 aa  86.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  27.45 
 
 
232 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2474  hypothetical protein  42.62 
 
 
104 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  32.95 
 
 
136 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  32.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  32.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  32.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>