97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2557 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 		 393 aa  786    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  54.26 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  51 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  53.75 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  46.27 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  42.96 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  45.7 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  42.96 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  46.46 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  45.28 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  44.09 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  43.31 
 
 		 358 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  42.91 
 
 		 358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  39.13 
 
 		 342 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  35.71 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  40 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  42.34 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  40.94 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  35.8 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  37.78 
 
 		 347 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  37.14 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  40 
 
 		 350 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  39.42 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  34.96 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  35.16 
 
 		 357 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  34.17 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  33.61 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  35 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  35 
 
 		 353 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  31.62 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  35.42 
 
 		 354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  33.21 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  30 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  34.6 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  33.92 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  31.22 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  30.04 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  28.38 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  30.4 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  26.59 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  30.74 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  31.91 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  29.87 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  33.78 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  33.78 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  30.74 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  33.78 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  30.36 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  27.02 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  26.94 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  31.74 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  59.77 
 
 		 199 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  33.49 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  30.83 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  30.59 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  30.6 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  28.51 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  32.14 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  31.17 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  31.14 
 
 		 356 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  29.49 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  30.47 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  30.2 
 
 		 245 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  32.02 
 
 		 323 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  31.53 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  47.41 
 
 		 120 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  29.36 
 
 		 358 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  28.57 
 
 		 407 aa  89.7  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  28.26 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  29.23 
 
 		 337 aa  89.7  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  28.26 
 
 		 349 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  29.72 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  29.86 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  27.78 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  27.83 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  29.71 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  29.65 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  29.41 
 
 		 367 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  29.41 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  29.41 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  26.52 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  36.51 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  31.73 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  28.64 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  29.85 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  26.56 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  27.6 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  26.47 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  28.57 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  35.88 
 
 		 160 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  28.29 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  29.11 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  29.13 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  24.43 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  31.3 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1218 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.36 
 
 		 2449 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>