96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0403 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  690    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  51.67 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  47.58 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  45.6 
 
 		 350 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  43.57 
 
 		 359 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  44.16 
 
 		 354 aa  252  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  43.03 
 
 		 375 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  42.81 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  42.86 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  42.51 
 
 		 387 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  41.64 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  41.64 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  39.24 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  40 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  41.61 
 
 		 378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  41.61 
 
 		 378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  41.61 
 
 		 378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  39.7 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  41.36 
 
 		 387 aa  209  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  40 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  37.8 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  37.46 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  38.39 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  41.52 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  36.84 
 
 		 367 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  37.23 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  39.36 
 
 		 400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  35.9 
 
 		 340 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  33.74 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  36.45 
 
 		 364 aa  175  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  34.78 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  32.93 
 
 		 384 aa  172  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  34.32 
 
 		 349 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  34.11 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  33.12 
 
 		 376 aa  168  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  33.53 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  35.22 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  37.7 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  33.66 
 
 		 369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  34.88 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  32.92 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  33.54 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  32.6 
 
 		 364 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  34.25 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  35.41 
 
 		 351 aa  159  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  34.49 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  32.52 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  32.92 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  33.74 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  32.93 
 
 		 382 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  32.56 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  31.03 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  31.91 
 
 		 348 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  30.28 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  33.94 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  33.64 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  32.73 
 
 		 361 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  32.01 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  30.65 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  32.41 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  31.76 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  30.18 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  37.19 
 
 		 245 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  31.8 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  31.58 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  35.12 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  28.31 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  28.66 
 
 		 357 aa  139  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  34.98 
 
 		 264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  30.23 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  28.44 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  30.32 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  31.97 
 
 		 344 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  32.8 
 
 		 350 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  29.35 
 
 		 353 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  28.66 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  31.44 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  29.45 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  29.58 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  26.63 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  29.09 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  28.86 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  28.04 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  30.47 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  34.57 
 
 		 217 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  26.59 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  27.38 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  26.48 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  28.06 
 
 		 393 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  27.1 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  24.04 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  32.22 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  30.67 
 
 		 160 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  26.13 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1901  hypothetical protein  41.18 
 
 		 92 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.95384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0058  hypothetical protein  34.85 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>