112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3201 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  724    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  59.33 
 
 
359 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  53.31 
 
 
354 aa  351  8.999999999999999e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  53.85 
 
 
339 aa  350  2e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  47.68 
 
 
389 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  45.17 
 
 
407 aa  318  9e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  45.51 
 
 
375 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  42.23 
 
 
389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  41.69 
 
 
387 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  41.69 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  40.24 
 
 
345 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  41.29 
 
 
388 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  45.78 
 
 
333 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  41.23 
 
 
378 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  41.23 
 
 
378 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  41.23 
 
 
378 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  41.59 
 
 
335 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  43.79 
 
 
349 aa  268  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  42.19 
 
 
341 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  41.55 
 
 
375 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  40.84 
 
 
367 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  41.69 
 
 
340 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  41.69 
 
 
367 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  41.69 
 
 
361 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  41.39 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  40.97 
 
 
375 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  40 
 
 
349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  36.94 
 
 
356 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  38.82 
 
 
351 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  38.72 
 
 
364 aa  219  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  37.07 
 
 
342 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  36.56 
 
 
355 aa  215  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  35.88 
 
 
353 aa  215  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  36.89 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  36.17 
 
 
364 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  37.42 
 
 
369 aa  209  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  34.96 
 
 
387 aa  209  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  53.3 
 
 
217 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  44.12 
 
 
400 aa  206  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  36.23 
 
 
347 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  34.25 
 
 
370 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  37.11 
 
 
323 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  35.89 
 
 
341 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  34.33 
 
 
365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  32.8 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  35.2 
 
 
337 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  33.9 
 
 
371 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  33.43 
 
 
358 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  32.65 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  32.64 
 
 
368 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  33.24 
 
 
364 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  32.95 
 
 
376 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  32.04 
 
 
354 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  31.25 
 
 
345 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  32.05 
 
 
342 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  33.24 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  33.13 
 
 
348 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  34.23 
 
 
358 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  32.04 
 
 
343 aa  181  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  32.44 
 
 
347 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  32.72 
 
 
361 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  30.63 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  32.84 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  32.42 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  30.52 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  29.43 
 
 
387 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  29.76 
 
 
378 aa  172  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  34.98 
 
 
344 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  39.5 
 
 
245 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  28.69 
 
 
381 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  31.14 
 
 
339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  27.09 
 
 
359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  28.21 
 
 
368 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  29.82 
 
 
338 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  30.15 
 
 
360 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  30.25 
 
 
335 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  30.03 
 
 
350 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  28.29 
 
 
381 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  29.91 
 
 
351 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  30.79 
 
 
353 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  29.46 
 
 
345 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  31.56 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  27.86 
 
 
349 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  29.59 
 
 
344 aa  149  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  31.56 
 
 
354 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  27.86 
 
 
339 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  32.08 
 
 
264 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  28.53 
 
 
343 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  23.27 
 
 
361 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  26.74 
 
 
353 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  30.04 
 
 
393 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  31.29 
 
 
160 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  32.23 
 
 
232 aa  86.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  42.34 
 
 
159 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  42.34 
 
 
159 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  42.34 
 
 
159 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  42.34 
 
 
136 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  27.88 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  51.43 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  30.65 
 
 
171 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>