112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  786    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  99.22 
 
 		 387 aa  777    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  88.59 
 
 		 389 aa  666    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  88.89 
 
 		 388 aa  683    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  80.6 
 
 		 378 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  80.6 
 
 		 378 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  80.05 
 
 		 378 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  86.24 
 
 		 341 aa  558  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  59.17 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  59.28 
 
 		 367 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  58.89 
 
 		 367 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  59.18 
 
 		 375 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  59 
 
 		 361 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  59.18 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  58.33 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  45.18 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  42.39 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  41.76 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  39.34 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  39.83 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  40.46 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  38.34 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  39.38 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  42.81 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  38.83 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  41.18 
 
 		 345 aa  238  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  40.11 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  37.61 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  39.67 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  37.77 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  36.53 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  35.41 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  38.22 
 
 		 400 aa  225  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  39.22 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  38.98 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  37.6 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  37.9 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  38.53 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  37.71 
 
 		 342 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  37.15 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  37.91 
 
 		 376 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  38.99 
 
 		 347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  37.5 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  36.86 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  36.31 
 
 		 358 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  33.24 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  35.2 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  33.33 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  35.07 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  33.68 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  34.72 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  34.05 
 
 		 357 aa  189  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  38.66 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  32.04 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  32.97 
 
 		 358 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  35.33 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  33.51 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  34.24 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  33.43 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  33.88 
 
 		 354 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  34.1 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  34.25 
 
 		 353 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  32.66 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  34.45 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  31.58 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  32.16 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  30.89 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  32.38 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  33.53 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  30.14 
 
 		 368 aa  166  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  29.53 
 
 		 357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  29.52 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  30.9 
 
 		 360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  32.18 
 
 		 345 aa  163  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  39.58 
 
 		 245 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  28.82 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  32.18 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  31.49 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  29.61 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  28.23 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  32.53 
 
 		 354 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  31.71 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  30.98 
 
 		 361 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  32.37 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  30.75 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  27.73 
 
 		 359 aa  140  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  35.71 
 
 		 264 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  39.63 
 
 		 217 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  31.48 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  51.2 
 
 		 159 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  51.2 
 
 		 159 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  51.2 
 
 		 159 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  50.79 
 
 		 136 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  31.39 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  40.82 
 
 		 160 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  31.17 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  32.14 
 
 		 235 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  34.22 
 
 		 232 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  48.31 
 
 		 71 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4863  hypothetical protein  59.09 
 
 		 75 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>