37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4863 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4863  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3302  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  62.5 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  62.5 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  62.5 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  62.5 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  62.5 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  62.5 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  62.12 
 
 
341 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  56.92 
 
 
367 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  56.92 
 
 
367 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  56.92 
 
 
361 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  59.09 
 
 
387 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  52.31 
 
 
367 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  56.92 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  59.09 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  56.92 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  59.09 
 
 
375 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  55.38 
 
 
378 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  56.06 
 
 
388 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  54.84 
 
 
389 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2724  hypothetical protein  64.29 
 
 
51 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  44.83 
 
 
217 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  67.57 
 
 
71 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  39.06 
 
 
340 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  41.33 
 
 
345 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  38.71 
 
 
350 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  39.66 
 
 
359 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  37.31 
 
 
349 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  40 
 
 
335 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  34.29 
 
 
389 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  35.19 
 
 
407 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3548  hypothetical protein  30.65 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.936527  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  44.07 
 
 
375 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  31.75 
 
 
235 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  36.73 
 
 
400 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  39.62 
 
 
347 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>