109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3525 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  92.64 
 
 
367 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  99.18 
 
 
367 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  98.89 
 
 
361 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  78.12 
 
 
375 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  80.23 
 
 
349 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  78.21 
 
 
375 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  58.95 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  59.44 
 
 
389 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  60.73 
 
 
378 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  59.17 
 
 
387 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  60.73 
 
 
378 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  60.73 
 
 
378 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  58.56 
 
 
388 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  61.51 
 
 
341 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  42.41 
 
 
345 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  38.92 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  41.25 
 
 
350 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  37.98 
 
 
340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  39.82 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  39.4 
 
 
359 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  38.41 
 
 
349 aa  237  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  38.86 
 
 
375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  36.99 
 
 
354 aa  232  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  39.26 
 
 
370 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  39.53 
 
 
376 aa  228  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  38.3 
 
 
339 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  38.35 
 
 
369 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  38.07 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  38.86 
 
 
342 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  33.94 
 
 
407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  38.44 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  36.46 
 
 
384 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  35.31 
 
 
371 aa  209  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  36.95 
 
 
351 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  34.36 
 
 
353 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  35.69 
 
 
400 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  33.53 
 
 
337 aa  203  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  35.4 
 
 
364 aa  203  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  36.84 
 
 
333 aa  202  6e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  35.42 
 
 
339 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  34.58 
 
 
364 aa  199  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  34.72 
 
 
356 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  36.42 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  35.95 
 
 
355 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  32.61 
 
 
365 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  33.76 
 
 
358 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  35.05 
 
 
358 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  35.69 
 
 
364 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  34.85 
 
 
338 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  33.81 
 
 
339 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  32.95 
 
 
349 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  32.5 
 
 
357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  32.37 
 
 
360 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  32.54 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  32.81 
 
 
345 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  31.98 
 
 
368 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  32.08 
 
 
357 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  33.04 
 
 
342 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  35.03 
 
 
341 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  32.21 
 
 
335 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  69.29 
 
 
136 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  31.82 
 
 
378 aa  172  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  66.42 
 
 
159 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  33.44 
 
 
348 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  66.42 
 
 
159 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  66.42 
 
 
159 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  32.81 
 
 
345 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  32.4 
 
 
347 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  31.63 
 
 
347 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  34.99 
 
 
344 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  34.19 
 
 
361 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  32.81 
 
 
353 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  32.15 
 
 
360 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  28.77 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  28.97 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  32.61 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  32.19 
 
 
353 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  29.01 
 
 
381 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  29.94 
 
 
381 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  29.58 
 
 
382 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  32.59 
 
 
350 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  31.01 
 
 
387 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  37.61 
 
 
245 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  31.16 
 
 
354 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  29.13 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  30.72 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  27.76 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  28.88 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  30.24 
 
 
343 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  41.58 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  34.41 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  28.62 
 
 
351 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  27.5 
 
 
353 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  39.73 
 
 
160 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  31.44 
 
 
232 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  29.55 
 
 
393 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  32.88 
 
 
235 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  58.33 
 
 
71 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4863  hypothetical protein  56.92 
 
 
75 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>