106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3597 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  713    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  62.28 
 
 
358 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  62.06 
 
 
354 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  62.42 
 
 
347 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  59.15 
 
 
358 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  58.19 
 
 
343 aa  417  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  59.23 
 
 
348 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  59.27 
 
 
345 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  58.05 
 
 
361 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  58.97 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  53.82 
 
 
368 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  54.55 
 
 
364 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  49.09 
 
 
387 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  53.49 
 
 
360 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  52.12 
 
 
342 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  50.52 
 
 
382 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  46.45 
 
 
368 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  54.76 
 
 
357 aa  362  6e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  48.01 
 
 
381 aa  354  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  43.7 
 
 
381 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  44.48 
 
 
359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  58.89 
 
 
264 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  46.18 
 
 
343 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  45.32 
 
 
345 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  43.77 
 
 
353 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  43.47 
 
 
353 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  45.2 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  41.18 
 
 
339 aa  283  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  43.98 
 
 
350 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  39.88 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  42.82 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  42.69 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  36.8 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  40.13 
 
 
338 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  40.78 
 
 
339 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  38.85 
 
 
349 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  36.86 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  35.28 
 
 
360 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  37.5 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  36.61 
 
 
356 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  37.02 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  39.11 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  38.97 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  37.07 
 
 
355 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  32.84 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  34.32 
 
 
364 aa  179  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  34.77 
 
 
364 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  36.25 
 
 
323 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  38.65 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  34.32 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  32.71 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  32.71 
 
 
361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  36.75 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  34.1 
 
 
389 aa  173  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  32.9 
 
 
350 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  33.05 
 
 
388 aa  172  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  34.1 
 
 
387 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  33.54 
 
 
349 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  34.1 
 
 
387 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  34.28 
 
 
378 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  32.4 
 
 
367 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  34.28 
 
 
378 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  34.28 
 
 
378 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  34.62 
 
 
345 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  30.87 
 
 
353 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  31.08 
 
 
367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  40.47 
 
 
232 aa  165  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  31.01 
 
 
375 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  31.83 
 
 
340 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  31.4 
 
 
342 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  30 
 
 
389 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  33.76 
 
 
349 aa  159  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  32.49 
 
 
359 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  33.22 
 
 
347 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  33.44 
 
 
341 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  34.38 
 
 
357 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  32.23 
 
 
375 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  31.97 
 
 
369 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  31.3 
 
 
375 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  55.47 
 
 
171 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  33.14 
 
 
376 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  37.35 
 
 
344 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  49.12 
 
 
199 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  32.07 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  32.97 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  31.76 
 
 
333 aa  147  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  31.99 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  28.09 
 
 
407 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  37.31 
 
 
245 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  37.33 
 
 
371 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  45.86 
 
 
160 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  41.84 
 
 
167 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  28.15 
 
 
378 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  25.5 
 
 
387 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  30.74 
 
 
400 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  44.12 
 
 
150 aa  96.3  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  51.69 
 
 
154 aa  92.8  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  38.53 
 
 
178 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  30.58 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  31.52 
 
 
120 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>