92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2044 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 
171 aa  354  2.9999999999999997e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  56.06 
 
 
358 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  58.91 
 
 
354 aa  161  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  51.95 
 
 
358 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  59.4 
 
 
347 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  55.47 
 
 
347 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  53.97 
 
 
345 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  53.78 
 
 
343 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  54.92 
 
 
348 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  52.5 
 
 
364 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  49.58 
 
 
368 aa  130  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  50.82 
 
 
343 aa  130  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  43.85 
 
 
360 aa  128  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  50 
 
 
357 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  52.1 
 
 
361 aa  124  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  47.54 
 
 
351 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  42.31 
 
 
342 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  47.97 
 
 
350 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  40.4 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  47.93 
 
 
350 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  50.48 
 
 
353 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  43.9 
 
 
339 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  45.04 
 
 
199 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  35.4 
 
 
368 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  39.68 
 
 
353 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  40.72 
 
 
382 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  36.81 
 
 
387 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  42.76 
 
 
154 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  40.5 
 
 
345 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  38.89 
 
 
353 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  40.16 
 
 
232 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  42.86 
 
 
354 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  33.33 
 
 
381 aa  97.1  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  32.52 
 
 
381 aa  95.9  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  40.71 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  37.19 
 
 
344 aa  94  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  31.65 
 
 
359 aa  87.4  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  31.58 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  38.84 
 
 
339 aa  75.5  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  35.29 
 
 
351 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  35.51 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  36.73 
 
 
339 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  33.67 
 
 
361 aa  70.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  33.06 
 
 
357 aa  70.9  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  29.06 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  30 
 
 
369 aa  68.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  32.52 
 
 
355 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  31.15 
 
 
356 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  32.5 
 
 
358 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  35.29 
 
 
344 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  31.09 
 
 
365 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  40.95 
 
 
387 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  40.95 
 
 
387 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  30.25 
 
 
353 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  33.06 
 
 
335 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  30.84 
 
 
349 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  30.65 
 
 
350 aa  61.6  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  31.67 
 
 
364 aa  61.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  32.06 
 
 
354 aa  60.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  35.29 
 
 
217 aa  60.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  30.16 
 
 
364 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  39.05 
 
 
388 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  32.2 
 
 
347 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  31.36 
 
 
342 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  34.78 
 
 
378 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  36.8 
 
 
378 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  36.8 
 
 
378 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  31.25 
 
 
349 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  36.63 
 
 
341 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  28.35 
 
 
345 aa  55.1  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  40 
 
 
389 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  28.48 
 
 
367 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  27.74 
 
 
341 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  27.78 
 
 
340 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  28.77 
 
 
361 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  26.67 
 
 
367 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  28.79 
 
 
359 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2446  protein of unknown function DUF1016  30.93 
 
 
301 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  28.67 
 
 
349 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  31.37 
 
 
323 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  35.29 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  35.29 
 
 
375 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  23.33 
 
 
367 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  31.33 
 
 
389 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  32.58 
 
 
375 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  47.5 
 
 
264 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  45.45 
 
 
393 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  30.11 
 
 
407 aa  40.8  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>