106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2094 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  714    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  67.59 
 
 
368 aa  519  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  62.74 
 
 
381 aa  489  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  53.5 
 
 
358 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  52.89 
 
 
358 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  52.74 
 
 
347 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  52.12 
 
 
347 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  51.46 
 
 
354 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  52.58 
 
 
345 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  46.9 
 
 
381 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  51.34 
 
 
350 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  48.79 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  48.79 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  47.81 
 
 
360 aa  355  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  45.01 
 
 
387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  46.7 
 
 
359 aa  348  9e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  48.22 
 
 
357 aa  345  4e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  50.15 
 
 
361 aa  345  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  48.8 
 
 
368 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  46.67 
 
 
364 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  42.7 
 
 
382 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  43.24 
 
 
339 aa  305  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  41.57 
 
 
345 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  39.58 
 
 
344 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  41.95 
 
 
343 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  40.72 
 
 
353 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  40.42 
 
 
353 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  41.32 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  41.54 
 
 
351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  41.79 
 
 
350 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  51.84 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  39.7 
 
 
353 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  35.01 
 
 
361 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  38.39 
 
 
338 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  36.78 
 
 
339 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  37.09 
 
 
335 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  37.11 
 
 
339 aa  208  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  37.17 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  35.83 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  38.96 
 
 
393 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  34.56 
 
 
354 aa  186  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  34.89 
 
 
345 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  33.13 
 
 
340 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  32.38 
 
 
350 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  32.54 
 
 
367 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  32.54 
 
 
361 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  32.74 
 
 
367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  33.33 
 
 
335 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  33.04 
 
 
367 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  32.91 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  40.67 
 
 
232 aa  169  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  33.44 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  34.04 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  30.47 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  32.48 
 
 
355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  32.27 
 
 
356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  30.94 
 
 
375 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  31.77 
 
 
353 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  31.56 
 
 
323 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  31.42 
 
 
349 aa  161  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  32.92 
 
 
337 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  29.75 
 
 
389 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  32.1 
 
 
342 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  31.83 
 
 
358 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  29.38 
 
 
378 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  41.18 
 
 
376 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  31.91 
 
 
370 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  29.1 
 
 
378 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  28.23 
 
 
387 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  29.1 
 
 
378 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  29.22 
 
 
389 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  30.18 
 
 
375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  28.96 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  27.7 
 
 
387 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  29.28 
 
 
341 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  28.42 
 
 
407 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  28.53 
 
 
369 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  31.27 
 
 
384 aa  149  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  42 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  28.53 
 
 
364 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  29.01 
 
 
365 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  29.75 
 
 
359 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  29.85 
 
 
347 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  34.72 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  28.44 
 
 
333 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  38.01 
 
 
199 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  34.43 
 
 
400 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  28.99 
 
 
387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  29.29 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  46.04 
 
 
160 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  33.33 
 
 
378 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  31.07 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  42.31 
 
 
171 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  27.61 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  40 
 
 
167 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  44.12 
 
 
150 aa  95.9  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  44.87 
 
 
154 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  28.71 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  31.25 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2446  protein of unknown function DUF1016  27.17 
 
 
301 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>