105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4438 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  709    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  48.96 
 
 
354 aa  342  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  51.2 
 
 
350 aa  338  9e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  47.9 
 
 
348 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  48.48 
 
 
358 aa  332  8e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  47.75 
 
 
347 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  47.11 
 
 
358 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  46.18 
 
 
347 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  48.99 
 
 
351 aa  316  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  46.01 
 
 
345 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  45.7 
 
 
364 aa  308  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  51.36 
 
 
353 aa  305  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  45.43 
 
 
350 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  45.35 
 
 
368 aa  299  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  44.74 
 
 
361 aa  295  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  41.27 
 
 
343 aa  287  1e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  40.17 
 
 
368 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  39.1 
 
 
387 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  41.95 
 
 
342 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  41.73 
 
 
382 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  40.9 
 
 
360 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  39.49 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  40.96 
 
 
339 aa  269  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  39.05 
 
 
357 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  38.11 
 
 
353 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  37.8 
 
 
353 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  33.61 
 
 
381 aa  250  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  50.8 
 
 
393 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  37.8 
 
 
354 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  35.44 
 
 
345 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  36.45 
 
 
344 aa  239  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  34.1 
 
 
359 aa  232  7.000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  46.53 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  36.84 
 
 
339 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  35.19 
 
 
338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  35.31 
 
 
349 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  32.04 
 
 
361 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  32.7 
 
 
360 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  31.1 
 
 
335 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  33.12 
 
 
364 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  31.9 
 
 
339 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  48.57 
 
 
199 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  31.53 
 
 
365 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  30.7 
 
 
349 aa  155  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  30.92 
 
 
354 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  37.98 
 
 
232 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  29.69 
 
 
335 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  32.82 
 
 
356 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  33.23 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  31.02 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  33.12 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  31.31 
 
 
355 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  30.72 
 
 
369 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  32.21 
 
 
378 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  34.78 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  30.41 
 
 
337 aa  145  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  32.21 
 
 
378 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  30.75 
 
 
387 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  32.21 
 
 
378 aa  145  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  29.08 
 
 
375 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  31.08 
 
 
388 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  53.78 
 
 
171 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  29.45 
 
 
347 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  31.06 
 
 
351 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  30.24 
 
 
367 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  31.15 
 
 
364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  29.23 
 
 
375 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  30.43 
 
 
389 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  29.94 
 
 
367 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  29.94 
 
 
361 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  28.53 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  30.84 
 
 
357 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  31.06 
 
 
341 aa  135  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  26.91 
 
 
389 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  27.76 
 
 
353 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  32.36 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  30.32 
 
 
375 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  28.92 
 
 
367 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  27.97 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  33.8 
 
 
376 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  43.14 
 
 
160 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  27.54 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  27.95 
 
 
349 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  33.95 
 
 
384 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  26.63 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  26.59 
 
 
370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  27.89 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  31.29 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  24.08 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  36.73 
 
 
167 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  32.44 
 
 
245 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  38.94 
 
 
178 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  25.87 
 
 
387 aa  98.6  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  45.19 
 
 
154 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  23.71 
 
 
400 aa  95.9  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  42.86 
 
 
150 aa  90.9  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  26.29 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  30.84 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  47.56 
 
 
120 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>