111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2348 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  88.89 
 
 
387 aa  683    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  88.42 
 
 
387 aa  684    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  88.55 
 
 
389 aa  654    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 
388 aa  795    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  81.82 
 
 
378 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  81.82 
 
 
378 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  81.56 
 
 
378 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  80.47 
 
 
341 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  58.56 
 
 
367 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  58.56 
 
 
367 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  58.29 
 
 
367 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  58.36 
 
 
375 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  58.01 
 
 
361 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  58.08 
 
 
375 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  58.06 
 
 
349 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  46.37 
 
 
375 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  41.18 
 
 
350 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  41.21 
 
 
389 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  38.79 
 
 
354 aa  264  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  40.32 
 
 
359 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  39.15 
 
 
340 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  38.83 
 
 
339 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  37.06 
 
 
407 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  39.54 
 
 
349 aa  245  8e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  37.39 
 
 
335 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  39.67 
 
 
345 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  39.5 
 
 
370 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  41.23 
 
 
351 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  36.53 
 
 
384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  41.64 
 
 
333 aa  233  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  38.28 
 
 
355 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  40.32 
 
 
400 aa  227  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  34.76 
 
 
353 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  38.46 
 
 
364 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  37.78 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  36.87 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  37.78 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  34.76 
 
 
371 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  35.48 
 
 
365 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  37.36 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  37.09 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  36.08 
 
 
342 aa  213  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  37.46 
 
 
364 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  37.85 
 
 
347 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  35.8 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  33.24 
 
 
337 aa  199  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  34.83 
 
 
368 aa  196  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  39.11 
 
 
344 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  32.8 
 
 
357 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  32.72 
 
 
382 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  33.98 
 
 
364 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  31.62 
 
 
358 aa  183  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  32.14 
 
 
378 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  33.69 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  32.66 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  31.61 
 
 
358 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  32.88 
 
 
348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  32.57 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  32.46 
 
 
354 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  33.05 
 
 
347 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  34.42 
 
 
353 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  33.52 
 
 
361 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  29.35 
 
 
344 aa  169  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  33.43 
 
 
339 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  40.5 
 
 
245 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  30 
 
 
357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  32.32 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  29.21 
 
 
360 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  32.88 
 
 
353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  32.09 
 
 
360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  30.59 
 
 
345 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  29.2 
 
 
387 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  30.95 
 
 
345 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  29.33 
 
 
368 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  29.82 
 
 
381 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  31.53 
 
 
350 aa  159  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  28.53 
 
 
381 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  32.23 
 
 
350 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  31.23 
 
 
361 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  31.52 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  28.96 
 
 
342 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  33.43 
 
 
354 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  30.72 
 
 
335 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  28.17 
 
 
359 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  31.08 
 
 
343 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  39.17 
 
 
217 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  33.6 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  30.65 
 
 
351 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  30.29 
 
 
353 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  48.82 
 
 
159 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  48.82 
 
 
159 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  48.82 
 
 
159 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  48.82 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  40.14 
 
 
160 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  31.62 
 
 
393 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  32.89 
 
 
232 aa  96.3  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  30.36 
 
 
235 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  57.14 
 
 
71 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4863  hypothetical protein  56.06 
 
 
75 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>