107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6349 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  61.96 
 
 
354 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  60.42 
 
 
345 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  59.23 
 
 
347 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  59.88 
 
 
347 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  58.24 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  58.75 
 
 
361 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  55.82 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  56.71 
 
 
358 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  51.51 
 
 
343 aa  377  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  48.79 
 
 
342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  52.63 
 
 
364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  46.01 
 
 
368 aa  355  6.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  44.47 
 
 
387 aa  352  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  46.7 
 
 
360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  47.07 
 
 
382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  43.17 
 
 
381 aa  343  4e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  50.75 
 
 
368 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  44.69 
 
 
381 aa  338  9e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  47.48 
 
 
357 aa  333  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  47.9 
 
 
343 aa  332  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  60.15 
 
 
264 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  41.91 
 
 
359 aa  318  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  47.75 
 
 
350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  41.14 
 
 
345 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  42.86 
 
 
353 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  42.55 
 
 
353 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  40.06 
 
 
339 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  43.93 
 
 
351 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  45.29 
 
 
353 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  41.64 
 
 
354 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  36.34 
 
 
344 aa  260  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  33.52 
 
 
361 aa  236  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  38.74 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  39.01 
 
 
339 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  37.88 
 
 
349 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  45.82 
 
 
393 aa  206  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  34.5 
 
 
360 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  35.2 
 
 
335 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  35.74 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  36.94 
 
 
364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  38.78 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  37.99 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  38.24 
 
 
337 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  36.55 
 
 
356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  35.4 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  35.4 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  35.4 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  34.41 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  34.17 
 
 
389 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  33.03 
 
 
354 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  33.23 
 
 
350 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  33.33 
 
 
345 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  33.51 
 
 
387 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  33.86 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  33.51 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  35.15 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  32.88 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  32.24 
 
 
353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  30.63 
 
 
335 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  33.44 
 
 
367 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  33.44 
 
 
367 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  32.05 
 
 
375 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  36.39 
 
 
323 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  33.12 
 
 
367 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  33.44 
 
 
361 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  36.12 
 
 
351 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  34.08 
 
 
349 aa  169  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  34.68 
 
 
364 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  32.06 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  31.12 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  31.85 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  52.69 
 
 
199 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  32.81 
 
 
347 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  32.43 
 
 
375 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  34.16 
 
 
341 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  30.59 
 
 
389 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  32.84 
 
 
359 aa  159  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  35.16 
 
 
341 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  35.29 
 
 
357 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  32.68 
 
 
376 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  31.91 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  37.56 
 
 
232 aa  150  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  29.11 
 
 
370 aa  149  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  39.44 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  26.36 
 
 
407 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  54.92 
 
 
171 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  28.45 
 
 
384 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  34.02 
 
 
371 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  36.12 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  29.11 
 
 
387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  32.76 
 
 
378 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  27.88 
 
 
400 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  47.33 
 
 
160 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  35.29 
 
 
167 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  44.12 
 
 
150 aa  97.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  41.59 
 
 
178 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  34.69 
 
 
154 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  33.17 
 
 
217 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2446  protein of unknown function DUF1016  32.77 
 
 
301 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>