109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0317 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 
345 aa  697    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  56.52 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  46.63 
 
 
354 aa  311  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  48.04 
 
 
359 aa  295  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  42.94 
 
 
375 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  44.92 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  39.74 
 
 
350 aa  269  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  40.87 
 
 
387 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  38.29 
 
 
389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  42.73 
 
 
367 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  42.41 
 
 
367 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  41.8 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  41.8 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  42.32 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  40.13 
 
 
340 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  40.58 
 
 
349 aa  249  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  41.46 
 
 
378 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  41.46 
 
 
378 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  41.46 
 
 
378 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  51.74 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  38.84 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  40.41 
 
 
389 aa  242  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  39.67 
 
 
388 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  41.18 
 
 
387 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  40.59 
 
 
387 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  36.9 
 
 
407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  39.08 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  39.24 
 
 
333 aa  229  8e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  39.83 
 
 
341 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  37.54 
 
 
370 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  35.54 
 
 
376 aa  215  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  36.66 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  34.29 
 
 
378 aa  202  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  36.36 
 
 
355 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  34.87 
 
 
384 aa  200  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  34.91 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  36.34 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  37.46 
 
 
323 aa  196  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  35.28 
 
 
371 aa  195  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  34.34 
 
 
364 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  33.84 
 
 
365 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  36.45 
 
 
345 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  36.36 
 
 
339 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  35.15 
 
 
335 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  35.56 
 
 
351 aa  185  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  37.65 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  30.51 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  33.23 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  34.89 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  33.24 
 
 
345 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  34.56 
 
 
347 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  31.95 
 
 
357 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  30.94 
 
 
342 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  31.63 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  34.32 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  33.05 
 
 
347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  34.89 
 
 
353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  32.93 
 
 
358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  34.89 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  35.51 
 
 
368 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  34.62 
 
 
350 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  31.25 
 
 
344 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  34.62 
 
 
347 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  34.01 
 
 
357 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  33.75 
 
 
354 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  32.63 
 
 
358 aa  169  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  34.12 
 
 
338 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  33.33 
 
 
360 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  33.23 
 
 
360 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  34.46 
 
 
364 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  35.14 
 
 
354 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  29.64 
 
 
368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  33.12 
 
 
341 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  44 
 
 
217 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  34.31 
 
 
339 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  31.29 
 
 
350 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  31.5 
 
 
349 aa  159  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  28.35 
 
 
382 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  35.24 
 
 
351 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  29.75 
 
 
361 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  27.65 
 
 
343 aa  150  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  29.41 
 
 
381 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  27.02 
 
 
359 aa  149  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  33.12 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  36.4 
 
 
245 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  28.12 
 
 
387 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  25.99 
 
 
381 aa  139  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  36.33 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  32.47 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  33.03 
 
 
393 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  32.88 
 
 
232 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  38.93 
 
 
160 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  29.44 
 
 
235 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1738  hypothetical protein  53.73 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  45.95 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  45.95 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  45.95 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  45.95 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  35.29 
 
 
167 aa  60.1  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>