53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1738 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1738  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  143  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  62.69 
 
 		 335 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  53.73 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  48.39 
 
 		 341 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  43.75 
 
 		 389 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  46.15 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  53.57 
 
 		 375 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  50.88 
 
 		 387 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  50.88 
 
 		 387 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  43.75 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  43.94 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  46.77 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  46.77 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  46.77 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  46.77 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  44.62 
 
 		 359 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  43.94 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  40.91 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  43.86 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  43.94 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  36.92 
 
 		 364 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  41.54 
 
 		 351 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  43.08 
 
 		 347 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  43.86 
 
 		 349 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  45.61 
 
 		 389 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  49.06 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  49.06 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  49.06 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  49.06 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  49.06 
 
 		 375 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  38.57 
 
 		 365 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  49.06 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  48.21 
 
 		 361 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  48.21 
 
 		 367 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  38.57 
 
 		 344 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  48.21 
 
 		 367 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  40 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  41.38 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  39.66 
 
 		 356 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  36.92 
 
 		 369 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  38.46 
 
 		 355 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  41.54 
 
 		 342 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  39.66 
 
 		 353 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  43.4 
 
 		 367 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  41.67 
 
 		 357 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1812  hypothetical protein  44 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00195671  hitchhiker  0.00000000124533 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  44.64 
 
 		 235 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  36.84 
 
 		 323 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  37.14 
 
 		 376 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  47.17 
 
 		 375 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  42.42 
 
 		 384 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  39.29 
 
 		 339 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  42.86 
 
 		 370 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>