99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0031 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  776    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  58.78 
 
 		 384 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  61.08 
 
 		 371 aa  427  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  53.08 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  41.78 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  42.94 
 
 		 375 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  38.86 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  36.87 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  38.06 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  36.11 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  38.79 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  39.53 
 
 		 367 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  39.53 
 
 		 367 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  39.24 
 
 		 361 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  38.92 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  38.78 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  37.91 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  37.91 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  38.98 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  35.54 
 
 		 345 aa  215  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  38.17 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  38.17 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  38.17 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  37.36 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  35.38 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  39.44 
 
 		 375 aa  209  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  37.78 
 
 		 349 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  37.87 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  39.69 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  34.43 
 
 		 354 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  32.87 
 
 		 339 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  31.94 
 
 		 407 aa  186  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  33.63 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  33.15 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  35.17 
 
 		 323 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  33.15 
 
 		 355 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  30.38 
 
 		 353 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  33.43 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  32.08 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  32.96 
 
 		 358 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  31.73 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  33.12 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  40.09 
 
 		 235 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  30.3 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  31.95 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  30.77 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  31.97 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  31.75 
 
 		 347 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  31.68 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  41.18 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  32.85 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  38.2 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  32.68 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  32.54 
 
 		 347 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  33.79 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  29.61 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  32.5 
 
 		 354 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  33.14 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  32.18 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  37.82 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  31.67 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  32.79 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  28.65 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  33.53 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  36.4 
 
 		 361 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  32.39 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  28.96 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  29.65 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  29.43 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  28.57 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  30.2 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  34.69 
 
 		 349 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  36.65 
 
 		 264 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  38.14 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  28.05 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  30.43 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  30.88 
 
 		 350 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  28.28 
 
 		 343 aa  125  9e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  29.71 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  30.53 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  33.8 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  28.78 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  27.48 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  27.79 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  28.95 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  34.65 
 
 		 354 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  27.63 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  41.33 
 
 		 160 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  27.89 
 
 		 351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  36.52 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  32.14 
 
 		 393 aa  99.8  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  30.99 
 
 		 217 aa  99.4  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  22.57 
 
 		 344 aa  96.3  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0058  hypothetical protein  58.93 
 
 		 119 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2474  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  26.07 
 
 		 232 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  34.04 
 
 		 120 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1716  hypothetical protein  42.03 
 
 		 95 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000229977  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1738  hypothetical protein  37.14 
 
 		 70 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>