100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4779 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  737    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  82.61 
 
 		 350 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  64.14 
 
 		 354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  57.43 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  58.05 
 
 		 347 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  57.78 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  58.75 
 
 		 348 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  53.8 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  51.98 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  51.48 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  48.35 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  52.62 
 
 		 364 aa  358  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  52.63 
 
 		 368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  47.66 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  52.51 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  46.54 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  44.68 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  50.15 
 
 		 342 aa  345  7e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  65.6 
 
 		 264 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  42.9 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  45.84 
 
 		 382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  43.23 
 
 		 359 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  44.74 
 
 		 343 aa  295  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  46.55 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  44.44 
 
 		 351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  40.12 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  45 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  45.17 
 
 		 353 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  43.88 
 
 		 353 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  44.38 
 
 		 354 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  39.33 
 
 		 339 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  34.33 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  34.53 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  38.85 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  36.56 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  36.15 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  36.45 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  34.67 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  34.88 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  41.6 
 
 		 393 aa  179  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  36.39 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  33.23 
 
 		 350 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  34.32 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  32.42 
 
 		 339 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  31.12 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  33.43 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  32.57 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  32.57 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  35.46 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  33.52 
 
 		 388 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  34.19 
 
 		 367 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  36.48 
 
 		 355 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  33.91 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  31.58 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  33.24 
 
 		 378 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  32.11 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  33.24 
 
 		 378 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  33.55 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  33.74 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  33.55 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  35.74 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  32.69 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  34.62 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  32.83 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  32.8 
 
 		 359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  32.37 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  34.23 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  32.13 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  30.65 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  48.55 
 
 		 199 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  31.42 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  33.94 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  29.85 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  32.24 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  33.21 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  38.4 
 
 		 371 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  32.73 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  33.01 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  34.52 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  34.62 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  28.35 
 
 		 407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  38.12 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  35.75 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  36.4 
 
 		 376 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  35.06 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  27.96 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  29.2 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  36.41 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  31.61 
 
 		 357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  35.51 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  36.06 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  52.1 
 
 		 171 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  33.05 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  38.15 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  43.09 
 
 		 178 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  44.79 
 
 		 150 aa  87  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  35.37 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  31.21 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  30.05 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  35.71 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>