106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1183 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  727    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  86.16 
 
 
353 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  85.03 
 
 
353 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  65.17 
 
 
339 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  59.82 
 
 
345 aa  428  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  53.61 
 
 
344 aa  383  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  46.73 
 
 
358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  46.81 
 
 
347 aa  309  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  44.55 
 
 
358 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  45.2 
 
 
347 aa  298  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  42.77 
 
 
360 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  43.77 
 
 
354 aa  289  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  41.32 
 
 
342 aa  286  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  40.46 
 
 
368 aa  286  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  39.54 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  41.64 
 
 
348 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  37.81 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  39.71 
 
 
364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  39.88 
 
 
343 aa  266  5.999999999999999e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  44.38 
 
 
361 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  41.34 
 
 
345 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  45.33 
 
 
338 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  38.81 
 
 
382 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  38.78 
 
 
361 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  59.9 
 
 
232 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  41.98 
 
 
360 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  39.26 
 
 
368 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  35.33 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  42.55 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  42.04 
 
 
350 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  37.8 
 
 
343 aa  252  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  44.16 
 
 
335 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  41.9 
 
 
339 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  38.44 
 
 
350 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  34.62 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  36.89 
 
 
357 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  37.5 
 
 
351 aa  212  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  45.18 
 
 
264 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  36.02 
 
 
353 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  36.01 
 
 
356 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  36.77 
 
 
358 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  35.15 
 
 
355 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  33.82 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  35.14 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  36.84 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  34.84 
 
 
364 aa  172  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  33.87 
 
 
353 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  34.05 
 
 
349 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  32.34 
 
 
339 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  37.09 
 
 
323 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  32.53 
 
 
387 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  33.43 
 
 
388 aa  169  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  34.11 
 
 
378 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  34.11 
 
 
378 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  34.11 
 
 
378 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  34.27 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  31.73 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  31.16 
 
 
367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  31.29 
 
 
335 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  34.67 
 
 
347 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  30.88 
 
 
367 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  33.33 
 
 
342 aa  161  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  31.03 
 
 
375 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  32.95 
 
 
351 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  30.56 
 
 
354 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  32 
 
 
361 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  33.52 
 
 
389 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  34.34 
 
 
341 aa  159  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  31.07 
 
 
364 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  31.53 
 
 
375 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  30.51 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  34.07 
 
 
341 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  31.38 
 
 
349 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  30.86 
 
 
350 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  32.1 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  35 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  30.06 
 
 
359 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  34.19 
 
 
344 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  36.49 
 
 
245 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  48.2 
 
 
160 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  29.14 
 
 
389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  29.3 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  28.72 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  28.79 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  29.56 
 
 
384 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  34.65 
 
 
376 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  28.53 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  25.86 
 
 
407 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  39.86 
 
 
167 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  42.86 
 
 
171 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  26.33 
 
 
387 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  30.97 
 
 
378 aa  106  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  29.14 
 
 
400 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  35.19 
 
 
199 aa  96.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  47.06 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  38.05 
 
 
178 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2446  protein of unknown function DUF1016  36.07 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  35.64 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  36.56 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>