96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5974 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  67.48 
 
 
350 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  65.6 
 
 
361 aa  342  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  62.98 
 
 
354 aa  338  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  60.15 
 
 
348 aa  321  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  61.66 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  58.89 
 
 
347 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  57.71 
 
 
347 aa  305  7e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  54.47 
 
 
343 aa  299  3e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  54.17 
 
 
364 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  52.59 
 
 
358 aa  288  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  50.19 
 
 
358 aa  285  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  52.12 
 
 
368 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  51.97 
 
 
387 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  54.36 
 
 
382 aa  275  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  50 
 
 
368 aa  270  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  51.84 
 
 
342 aa  265  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  50.21 
 
 
381 aa  261  6e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  50 
 
 
360 aa  261  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  50.19 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  46.44 
 
 
381 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  46.32 
 
 
359 aa  229  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  46.53 
 
 
343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  44.27 
 
 
350 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  45.18 
 
 
354 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  44.74 
 
 
353 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  44.74 
 
 
353 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  42.32 
 
 
339 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  41.84 
 
 
345 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  37.82 
 
 
344 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  41.41 
 
 
361 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  42.26 
 
 
393 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  41.6 
 
 
351 aa  178  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  42.31 
 
 
353 aa  165  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  38.15 
 
 
339 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  36.32 
 
 
335 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  35.41 
 
 
349 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  37.5 
 
 
338 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  34.16 
 
 
360 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  33.74 
 
 
339 aa  142  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  35.71 
 
 
389 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  38.91 
 
 
371 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  33.18 
 
 
350 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  35.71 
 
 
387 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  36.36 
 
 
335 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  34.98 
 
 
333 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  37.04 
 
 
384 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  37.26 
 
 
349 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  35.29 
 
 
387 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  36.33 
 
 
345 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  34.41 
 
 
367 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  33.6 
 
 
388 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  35.09 
 
 
375 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  39.06 
 
 
337 aa  135  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  33.88 
 
 
354 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  36.65 
 
 
376 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  37 
 
 
375 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  34.01 
 
 
361 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  34.73 
 
 
367 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  36.84 
 
 
370 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  33.88 
 
 
364 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  33.76 
 
 
375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  37.56 
 
 
356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  34.73 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  32.54 
 
 
378 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  32.54 
 
 
378 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  32.54 
 
 
378 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  32.16 
 
 
369 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  34.86 
 
 
340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  34.58 
 
 
389 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  37.81 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  35.86 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  36.24 
 
 
349 aa  126  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  33.21 
 
 
364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  33.33 
 
 
407 aa  125  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  32.16 
 
 
353 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  33.19 
 
 
358 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  36.22 
 
 
341 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  29.77 
 
 
323 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  34.78 
 
 
378 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  31.71 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  35.58 
 
 
365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  30.23 
 
 
342 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  32.5 
 
 
347 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  35.12 
 
 
351 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  35.43 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  33 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  32.52 
 
 
400 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  33.04 
 
 
357 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  33.98 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  41.58 
 
 
150 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  52.94 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  35.9 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  37.68 
 
 
120 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  47.5 
 
 
171 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>