100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1088 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  712    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  82.61 
 
 		 361 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  63.31 
 
 		 354 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  59.76 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  58.97 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  58.24 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  56.4 
 
 		 358 aa  391  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  53.35 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  57.53 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  52.89 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  51.34 
 
 		 342 aa  359  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  51.6 
 
 		 364 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  48.88 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  45.77 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  49.44 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  48.07 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  52.14 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  51.94 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  67.48 
 
 		 264 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  48 
 
 		 382 aa  341  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  45.08 
 
 		 381 aa  335  7e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  45.75 
 
 		 359 aa  317  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  45.43 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  45.07 
 
 		 350 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  41.14 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  43.18 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  42.99 
 
 		 353 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  42.86 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  43.95 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  38.99 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  42.04 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  37.15 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  35.65 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  37.15 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  37.16 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  37.62 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  37.79 
 
 		 349 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  35.49 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  34.03 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  35.54 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  35.69 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  36.57 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  42.11 
 
 		 393 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  36.13 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  36.09 
 
 		 355 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  36.45 
 
 		 356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  34.62 
 
 		 345 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  33.96 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  33.77 
 
 		 350 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  34.54 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  32.93 
 
 		 354 aa  166  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  32.12 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  32.58 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  32.9 
 
 		 335 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  35.34 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  32.12 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  32.17 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  34.37 
 
 		 378 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  34.37 
 
 		 378 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  32.27 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  34.37 
 
 		 378 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  32.04 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  33.62 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  32.27 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  32.59 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  31.49 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  31.25 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  31.04 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  33.64 
 
 		 347 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  32.23 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  40 
 
 		 371 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  32.6 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  30.79 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  33.23 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  41.31 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  33.24 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  38.01 
 
 		 384 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  37.82 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  30.23 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  30.55 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  32.41 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  46.29 
 
 		 199 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  37.13 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  32.82 
 
 		 341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  33.04 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  33.82 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  31.67 
 
 		 375 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  36.45 
 
 		 245 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  36.89 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  34.33 
 
 		 378 aa  129  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  34.1 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  34.05 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  47.93 
 
 		 171 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  37.41 
 
 		 154 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  39.66 
 
 		 178 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  45.1 
 
 		 150 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  27.87 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>