106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1236 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  742    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  61.65 
 
 		 351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  57.35 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  57.23 
 
 		 364 aa  415  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  57.19 
 
 		 355 aa  411  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  55.35 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  49.58 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  56.8 
 
 		 344 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  56.96 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  52.35 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  52.41 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  52.92 
 
 		 342 aa  365  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  48.78 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  51.17 
 
 		 337 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  62.77 
 
 		 245 aa  315  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  43.03 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  42.11 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  39.14 
 
 		 339 aa  236  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  40.88 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  39.88 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  38.46 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  38.53 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  38.24 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  39.51 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  40.3 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  40.3 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  40.3 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  38.24 
 
 		 350 aa  222  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  36.04 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  39.51 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  34.58 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  36.78 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  34.87 
 
 		 367 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  37.62 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  36 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  37.3 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  34.91 
 
 		 345 aa  206  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  34.58 
 
 		 367 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  37.58 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  38.61 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  36.65 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  39.59 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  34.94 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  34.21 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  35.82 
 
 		 335 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  37.43 
 
 		 345 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  35.76 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  33.64 
 
 		 347 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  35.47 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  33.92 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  34.32 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  34.07 
 
 		 354 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  32.08 
 
 		 376 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  34.68 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  36.45 
 
 		 333 aa  176  8e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  34.82 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  32.18 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  31.75 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  31.4 
 
 		 370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  34.04 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  32.46 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  33.65 
 
 		 345 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  31.14 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  34 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  33.88 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  29.78 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  33.14 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  31.48 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  30.24 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  33.01 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  29.94 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  30.55 
 
 		 407 aa  159  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  31.51 
 
 		 357 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  31.07 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  40.34 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  29.41 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  34.58 
 
 		 350 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  31.9 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  30.13 
 
 		 368 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  30.66 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  30.56 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  28.06 
 
 		 387 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  31.46 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  28.79 
 
 		 361 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  28.49 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  29.43 
 
 		 378 aa  132  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  33.88 
 
 		 264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  45.95 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  28.65 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  35.03 
 
 		 217 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  28.03 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  30.6 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  28.57 
 
 		 232 aa  92.8  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  25.74 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  30.16 
 
 		 171 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  37.78 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  37.78 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  37.78 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  37.78 
 
 		 136 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0178  hypothetical protein  40 
 
 		 56 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>