103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1226 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 		 232 aa  477  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  60.91 
 
 		 345 aa  295  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  60.75 
 
 		 339 aa  285  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  60.66 
 
 		 353 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  59.72 
 
 		 353 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  59.9 
 
 		 354 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  51.36 
 
 		 344 aa  242  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  44.44 
 
 		 358 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  43.4 
 
 		 358 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  40.67 
 
 		 342 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  42.58 
 
 		 347 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  40.47 
 
 		 347 aa  165  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  41.75 
 
 		 354 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  36.93 
 
 		 368 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  38.5 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  37.98 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  37.56 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  38.83 
 
 		 345 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  38.07 
 
 		 360 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  38.46 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  33.47 
 
 		 381 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  41.09 
 
 		 335 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  36.41 
 
 		 368 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  38 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  35.92 
 
 		 364 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  33.18 
 
 		 343 aa  138  8.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  36.71 
 
 		 350 aa  134  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  32.05 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  31.35 
 
 		 381 aa  132  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  31.64 
 
 		 382 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  36.89 
 
 		 350 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  36.41 
 
 		 361 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  30.8 
 
 		 387 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  38.04 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  33.2 
 
 		 361 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  32.38 
 
 		 357 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  43.54 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  34.76 
 
 		 351 aa  118  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  35.55 
 
 		 353 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  31.44 
 
 		 367 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  31 
 
 		 367 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  31 
 
 		 361 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  32.74 
 
 		 347 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  34.7 
 
 		 339 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  40.16 
 
 		 171 aa  101  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  30.84 
 
 		 358 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  31.14 
 
 		 349 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  31.08 
 
 		 355 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  29.26 
 
 		 367 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  32.88 
 
 		 345 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  33.18 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  33.18 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  33.18 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  33.04 
 
 		 389 aa  99  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  34.22 
 
 		 387 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  32.17 
 
 		 387 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  32.89 
 
 		 388 aa  96.3  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  32.13 
 
 		 341 aa  95.5  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  29.25 
 
 		 364 aa  95.5  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  30.24 
 
 		 323 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  30.7 
 
 		 351 aa  95.1  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  27.03 
 
 		 369 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  29.49 
 
 		 353 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  31.82 
 
 		 337 aa  92.8  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  28.38 
 
 		 356 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  31.9 
 
 		 354 aa  92  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  28.5 
 
 		 365 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  28.51 
 
 		 375 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  30.56 
 
 		 344 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  30.41 
 
 		 340 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  32.7 
 
 		 350 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  31.85 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  29.76 
 
 		 375 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  28.42 
 
 		 364 aa  85.5  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  29.8 
 
 		 357 aa  85.1  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  27.75 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  30.32 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  29.72 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  30.93 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  43.02 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  35.9 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2446  protein of unknown function DUF1016  33.09 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  27.2 
 
 		 389 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  35.29 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  37.5 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  29.27 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  26.74 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  31.3 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  28.81 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  27.45 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  28.81 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  26.13 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  28 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  26.07 
 
 		 376 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  30.84 
 
 		 159 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  30.84 
 
 		 159 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  30.84 
 
 		 159 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  21.71 
 
 		 407 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  30.84 
 
 		 136 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  32 
 
 		 371 aa  48.5  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>