105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0307 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 
364 aa  738    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  60.73 
 
 
351 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  59.02 
 
 
356 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  60.71 
 
 
365 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  58.51 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  58.04 
 
 
358 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  57.23 
 
 
364 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  63.58 
 
 
344 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  62.22 
 
 
323 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  58.21 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  58.16 
 
 
369 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  55.62 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  56.47 
 
 
347 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  50.74 
 
 
337 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  48 
 
 
357 aa  325  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  63.07 
 
 
245 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  48.13 
 
 
341 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  37.8 
 
 
354 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  38.15 
 
 
339 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  40.06 
 
 
338 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  37.78 
 
 
387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  38.35 
 
 
349 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  36.83 
 
 
389 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  37.46 
 
 
388 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  37.5 
 
 
387 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  39.64 
 
 
339 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  34.26 
 
 
361 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  36.42 
 
 
360 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  35.51 
 
 
350 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  35.4 
 
 
367 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  35.4 
 
 
367 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  35.1 
 
 
367 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  36.86 
 
 
378 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  36.86 
 
 
378 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  36.86 
 
 
378 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  34.66 
 
 
358 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  34.93 
 
 
349 aa  195  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  34.52 
 
 
335 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  37.46 
 
 
359 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  34.34 
 
 
345 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  33.23 
 
 
340 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  35.58 
 
 
335 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  32.69 
 
 
375 aa  186  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  36.94 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  34.38 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  36.18 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  34.9 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  34.87 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  33.92 
 
 
347 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  33.16 
 
 
389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  33.14 
 
 
345 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  34.02 
 
 
353 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  32.59 
 
 
375 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  32.69 
 
 
375 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  34.77 
 
 
347 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  30.88 
 
 
344 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  30.94 
 
 
371 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  33.13 
 
 
349 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  31.69 
 
 
370 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  35.03 
 
 
364 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  34.31 
 
 
345 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  33.96 
 
 
368 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  33.63 
 
 
354 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  36.65 
 
 
384 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  34.84 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  30.77 
 
 
376 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  32.26 
 
 
357 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  34.23 
 
 
361 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  33.62 
 
 
350 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  33.12 
 
 
343 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  32.6 
 
 
333 aa  159  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  32.84 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  33.87 
 
 
350 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  32.88 
 
 
360 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  32.03 
 
 
382 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  29.72 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  28.53 
 
 
342 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  29.4 
 
 
368 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  28.32 
 
 
361 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  34.01 
 
 
387 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  34.57 
 
 
400 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  27.93 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  28.76 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  28.99 
 
 
351 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  26.94 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  33.75 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  33.21 
 
 
264 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  44.9 
 
 
160 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  29.89 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  26.54 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  32.57 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  31.84 
 
 
393 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  29.25 
 
 
232 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  24.46 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  31.67 
 
 
171 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0178  hypothetical protein  45.45 
 
 
56 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>