101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0539 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  729    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  53.65 
 
 
381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  45.87 
 
 
368 aa  349  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  46.7 
 
 
342 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  46.65 
 
 
381 aa  346  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  44.62 
 
 
387 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  47.65 
 
 
358 aa  341  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  44.48 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  44.31 
 
 
347 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  41.82 
 
 
382 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  44.51 
 
 
358 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  44.16 
 
 
343 aa  320  3e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  45.75 
 
 
350 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  41.91 
 
 
348 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  43.23 
 
 
361 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  42.06 
 
 
345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  42.33 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  40.78 
 
 
354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  41.38 
 
 
364 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  39.24 
 
 
368 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  40.34 
 
 
357 aa  272  7e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  36.76 
 
 
344 aa  249  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  36.31 
 
 
339 aa  245  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  35.1 
 
 
361 aa  242  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  35.61 
 
 
345 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  34.1 
 
 
343 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  33.82 
 
 
353 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  46.32 
 
 
264 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  33.43 
 
 
353 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  34.62 
 
 
354 aa  225  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  32.16 
 
 
350 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  32.39 
 
 
351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  32.58 
 
 
353 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  33.89 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  33.12 
 
 
338 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  33.12 
 
 
335 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  29.43 
 
 
349 aa  182  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  31.83 
 
 
360 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  27.91 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  28.35 
 
 
339 aa  159  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  28.45 
 
 
340 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  27.93 
 
 
367 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  29.19 
 
 
354 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  33.05 
 
 
393 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  27.02 
 
 
345 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  29.07 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  29.07 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  29.07 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  30.51 
 
 
335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  27.76 
 
 
367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  27.6 
 
 
361 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  28.17 
 
 
388 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  28.44 
 
 
375 aa  146  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  27.76 
 
 
367 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  27.32 
 
 
389 aa  146  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  29.11 
 
 
349 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  28.49 
 
 
349 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  30.74 
 
 
337 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  28.49 
 
 
389 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  27.73 
 
 
387 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  27.73 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  29.78 
 
 
341 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  28.31 
 
 
375 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  27.54 
 
 
359 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  30.22 
 
 
375 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  29.52 
 
 
353 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  29.43 
 
 
376 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  26.69 
 
 
365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  32.05 
 
 
232 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  27.15 
 
 
407 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  28.49 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  29.47 
 
 
384 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  35.48 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  27.16 
 
 
351 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  28.66 
 
 
333 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  24.44 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  26.61 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  26.54 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  27.43 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  26.8 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  27.24 
 
 
323 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  25.73 
 
 
400 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  39.86 
 
 
160 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  25.31 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  25.81 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  26.35 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  25.17 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  24.78 
 
 
387 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  23.55 
 
 
357 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  25.51 
 
 
378 aa  105  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  27.51 
 
 
344 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  39.53 
 
 
150 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  29.5 
 
 
245 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  32.59 
 
 
167 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  27.03 
 
 
199 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  31.65 
 
 
171 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  29.93 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  25.2 
 
 
178 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  21.52 
 
 
217 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2446  protein of unknown function DUF1016  26.23 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>