92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4764 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  323  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  84.71 
 
 		 338 aa  273  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  82.17 
 
 		 339 aa  266  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  69.94 
 
 		 349 aa  233  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  64.19 
 
 		 360 aa  210  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  61.78 
 
 		 335 aa  210  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  48.2 
 
 		 354 aa  134  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  45.89 
 
 		 342 aa  133  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  48.46 
 
 		 353 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  48.48 
 
 		 339 aa  130  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  47.22 
 
 		 354 aa  130  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  45.99 
 
 		 345 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  45.95 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  47.69 
 
 		 353 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  44.9 
 
 		 337 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  46.04 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  42.21 
 
 		 368 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  47.22 
 
 		 347 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  46.38 
 
 		 345 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  37.82 
 
 		 344 aa  125  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  41.73 
 
 		 381 aa  124  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  47.33 
 
 		 348 aa  124  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  44.76 
 
 		 358 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  44.78 
 
 		 364 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  45.86 
 
 		 347 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  45 
 
 		 360 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  44.9 
 
 		 364 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  43.14 
 
 		 343 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  44.52 
 
 		 365 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  42.57 
 
 		 356 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  42.97 
 
 		 361 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  38.1 
 
 		 353 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  41.67 
 
 		 264 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  39.86 
 
 		 359 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  42.86 
 
 		 358 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  40 
 
 		 369 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  41.5 
 
 		 323 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  42.86 
 
 		 350 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  41.54 
 
 		 381 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  42.86 
 
 		 341 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  41.33 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  41.22 
 
 		 355 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  38.15 
 
 		 361 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  41.98 
 
 		 387 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  39.86 
 
 		 358 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  39.86 
 
 		 245 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  38.46 
 
 		 343 aa  110  8.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  40 
 
 		 375 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  39.31 
 
 		 371 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  40.14 
 
 		 388 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  40.82 
 
 		 387 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  40.82 
 
 		 387 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  39.73 
 
 		 367 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  39.73 
 
 		 389 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  39.73 
 
 		 367 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  39.73 
 
 		 361 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  39.73 
 
 		 367 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  39.16 
 
 		 335 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  38.36 
 
 		 382 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  39.73 
 
 		 375 aa  104  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  39.62 
 
 		 349 aa  104  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  36.54 
 
 		 357 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  37.06 
 
 		 378 aa  103  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  36.49 
 
 		 339 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  37.33 
 
 		 384 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  39.04 
 
 		 375 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  35.81 
 
 		 359 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  36.75 
 
 		 350 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  38.1 
 
 		 347 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  32.7 
 
 		 340 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  37.86 
 
 		 349 aa  100  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  38.93 
 
 		 345 aa  100  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  43.87 
 
 		 344 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  37.41 
 
 		 378 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  38.85 
 
 		 370 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  37.41 
 
 		 378 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  37.41 
 
 		 378 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  39.19 
 
 		 351 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  39.29 
 
 		 368 aa  98.6  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  37.84 
 
 		 357 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  33.78 
 
 		 407 aa  97.1  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  38.41 
 
 		 353 aa  96.7  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  40.69 
 
 		 351 aa  94.4  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  31.16 
 
 		 350 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  34.38 
 
 		 400 aa  91.7  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  31.76 
 
 		 354 aa  90.9  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  32.67 
 
 		 389 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  41.44 
 
 		 341 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  34.29 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  30.67 
 
 		 333 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  35.71 
 
 		 393 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  35.92 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>