99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1011 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  801    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  59.79 
 
 
382 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  51.19 
 
 
358 aa  398  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  52.03 
 
 
343 aa  391  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  52.56 
 
 
347 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  50.13 
 
 
381 aa  389  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  49.87 
 
 
358 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  49.09 
 
 
347 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  47.4 
 
 
368 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  46.44 
 
 
360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  45.77 
 
 
350 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  45.01 
 
 
342 aa  353  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  44.47 
 
 
348 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  46.11 
 
 
345 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  44.68 
 
 
361 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  45.43 
 
 
354 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  44.77 
 
 
381 aa  345  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  44.62 
 
 
359 aa  343  2e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  45 
 
 
364 aa  332  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  45.53 
 
 
368 aa  328  9e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  44.36 
 
 
357 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  39.95 
 
 
345 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  39.1 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  51.97 
 
 
264 aa  279  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  37.53 
 
 
339 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  37.74 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  37.47 
 
 
353 aa  272  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  37.81 
 
 
354 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  35.29 
 
 
344 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  33.88 
 
 
361 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  36.49 
 
 
350 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  35.16 
 
 
351 aa  243  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  33.07 
 
 
353 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  40.62 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  29.88 
 
 
349 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  31.3 
 
 
335 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  30.34 
 
 
338 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  32.75 
 
 
407 aa  176  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  31.01 
 
 
339 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  30.34 
 
 
375 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  30.49 
 
 
378 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  30.49 
 
 
378 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  30.49 
 
 
378 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  31.52 
 
 
387 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  30.89 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  29.64 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  30.27 
 
 
360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  30.32 
 
 
375 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  30.47 
 
 
354 aa  164  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  29.2 
 
 
388 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  30.18 
 
 
389 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  29.78 
 
 
389 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  30.61 
 
 
367 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  30.39 
 
 
339 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  30.61 
 
 
361 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  29.38 
 
 
335 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  31.01 
 
 
367 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  28.38 
 
 
340 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  29.45 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  30.15 
 
 
356 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  29.61 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  30.88 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  30.16 
 
 
337 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  49.06 
 
 
150 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  31.09 
 
 
341 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  30.29 
 
 
355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  29.81 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  27.84 
 
 
353 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  28.92 
 
 
323 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  29.97 
 
 
370 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  28.12 
 
 
345 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  28.61 
 
 
364 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  29.49 
 
 
349 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  27.89 
 
 
359 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  35.12 
 
 
333 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  28.26 
 
 
400 aa  135  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  27.93 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  29.22 
 
 
351 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  26.58 
 
 
384 aa  133  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  28.61 
 
 
387 aa  132  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  42.77 
 
 
154 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  37.13 
 
 
245 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  29.66 
 
 
365 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  30.8 
 
 
232 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  26.32 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  36.49 
 
 
371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  27.1 
 
 
375 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  27.16 
 
 
378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  25.84 
 
 
369 aa  127  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  28.18 
 
 
357 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  27.59 
 
 
347 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  42.41 
 
 
167 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  26.38 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  30.1 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  41.98 
 
 
160 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  31.86 
 
 
199 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  36.81 
 
 
171 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  29.9 
 
 
178 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  30.59 
 
 
120 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>