105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1539 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  785    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  59.79 
 
 		 387 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  51.6 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  50.52 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  50.66 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  48.15 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  49.32 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  45.17 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  45.58 
 
 		 381 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  48.01 
 
 		 354 aa  345  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  45.48 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  47.07 
 
 		 348 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  48 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  45.03 
 
 		 381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  45.36 
 
 		 345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  46.7 
 
 		 364 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  47.2 
 
 		 368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  45.84 
 
 		 361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  41.82 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  42.7 
 
 		 342 aa  319  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  44.62 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  41.73 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  37.99 
 
 		 345 aa  276  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  54.36 
 
 		 264 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  36.94 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  38.65 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  38.92 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  38.81 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  37.23 
 
 		 350 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  32.8 
 
 		 361 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  34.32 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  36.44 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  35.41 
 
 		 353 aa  209  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  33.07 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  32.72 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  32.02 
 
 		 349 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  33.06 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  33.71 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  33.71 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  33.71 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  32.85 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  32.19 
 
 		 338 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  32.6 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  31.2 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  38.66 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  30.56 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  34.17 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  30.56 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  30.16 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  32.32 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  30.42 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  30.42 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  29.18 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  30.94 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  31.97 
 
 		 376 aa  163  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  32.11 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  34.33 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  29.52 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  29.58 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  30.9 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  29.02 
 
 		 360 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  29.88 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  30.26 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  28.35 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  32.93 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  29.78 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  29.71 
 
 		 359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  30.84 
 
 		 337 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  30.68 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  31.15 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  28.91 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  28.76 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  31.47 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  28.06 
 
 		 353 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  30.21 
 
 		 355 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  32.03 
 
 		 364 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  30.49 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  30.45 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  29.58 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  30.55 
 
 		 323 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  30 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  27.35 
 
 		 369 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  26.65 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  31.64 
 
 		 232 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  28.19 
 
 		 378 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  29.73 
 
 		 341 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  27.58 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  48.47 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  34.87 
 
 		 245 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  36.57 
 
 		 199 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  41.77 
 
 		 150 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  38.55 
 
 		 167 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  30.55 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  40.72 
 
 		 171 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  38.36 
 
 		 160 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  38.24 
 
 		 178 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  26.83 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  27.21 
 
 		 159 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>