69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2614 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  48.68 
 
 		 358 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  48.85 
 
 		 351 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  51.18 
 
 		 347 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  52.69 
 
 		 348 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  52.41 
 
 		 354 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  48.57 
 
 		 343 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  48.55 
 
 		 361 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  50.87 
 
 		 353 aa  158  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  48.85 
 
 		 345 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  44.32 
 
 		 350 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  47.09 
 
 		 358 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  46.01 
 
 		 343 aa  152  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  49.12 
 
 		 347 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  46.29 
 
 		 350 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  44.44 
 
 		 364 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  43.08 
 
 		 368 aa  141  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  39.56 
 
 		 360 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  38.01 
 
 		 342 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  37.5 
 
 		 357 aa  118  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  36.57 
 
 		 382 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  45.04 
 
 		 171 aa  111  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  31.86 
 
 		 387 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  31.44 
 
 		 381 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  59.77 
 
 		 393 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  32.28 
 
 		 339 aa  101  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  28.93 
 
 		 368 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  32.75 
 
 		 353 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  30.43 
 
 		 345 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  32.16 
 
 		 353 aa  94.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  40.14 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  30.86 
 
 		 344 aa  92.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  27.03 
 
 		 359 aa  87.8  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  31.85 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  35.19 
 
 		 354 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  30.28 
 
 		 167 aa  85.5  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  25.96 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  52.94 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  31.41 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  31.29 
 
 		 339 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  27.23 
 
 		 361 aa  65.1  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  39.51 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  38.36 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  28.64 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  31.69 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  32.92 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  32.92 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  32.92 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  36.13 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  30.91 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  28.36 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  28.36 
 
 		 387 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  31.16 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  34.38 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  27.61 
 
 		 367 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  25.18 
 
 		 335 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  24.18 
 
 		 340 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  27.93 
 
 		 388 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  31.03 
 
 		 359 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  34.15 
 
 		 357 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  27.84 
 
 		 389 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  26.22 
 
 		 361 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  26.22 
 
 		 367 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  26.09 
 
 		 350 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  28.28 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  26.38 
 
 		 367 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  32.08 
 
 		 337 aa  42.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>