105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2940 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  785    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  53.65 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  52.04 
 
 		 368 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  50.79 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  50.13 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  46.9 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  45.29 
 
 		 358 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  46.34 
 
 		 358 aa  355  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  43.7 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  45.65 
 
 		 343 aa  349  4e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  45.33 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  45.63 
 
 		 347 aa  348  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  45.58 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  43.17 
 
 		 348 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  45.08 
 
 		 350 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  41.26 
 
 		 354 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  42.9 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  40.87 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  42.55 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  45.11 
 
 		 357 aa  312  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  38.9 
 
 		 368 aa  289  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  39.24 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  35.86 
 
 		 345 aa  265  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  35.87 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  35.6 
 
 		 353 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  34.58 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  46.44 
 
 		 264 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  33.61 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  35.33 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  33.06 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  32.24 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  32.05 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  29.86 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  32.82 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  32.43 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  30.13 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  29.53 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  30.52 
 
 		 339 aa  173  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  29.57 
 
 		 389 aa  169  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  33.53 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  28.72 
 
 		 349 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  27.73 
 
 		 349 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  29.11 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  29.52 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  29.94 
 
 		 361 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  29.94 
 
 		 367 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  29.46 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  33.61 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  29.82 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  29.94 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  29.19 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  30.9 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  28.84 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  28.84 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  28.84 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  30 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  29.64 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  29.91 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  29.3 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  28.46 
 
 		 375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  28.53 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  30.28 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  25.99 
 
 		 345 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  27.59 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  37.02 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  30.03 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  27.79 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  27.57 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  31.35 
 
 		 232 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  25.93 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  29.14 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  26.52 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  28.21 
 
 		 323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  28.61 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  28.76 
 
 		 364 aa  129  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  27.55 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  26.04 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  28.78 
 
 		 376 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  26.72 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  35.32 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  28 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  24.93 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  25.85 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  25.98 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  34 
 
 		 245 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  41.54 
 
 		 160 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  26.46 
 
 		 347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  26.77 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  27.98 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  39.51 
 
 		 167 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  29.3 
 
 		 344 aa  99.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  45.1 
 
 		 150 aa  96.7  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  44.9 
 
 		 171 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  34.87 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  25.96 
 
 		 199 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  34.62 
 
 		 178 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  28.23 
 
 		 136 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  28.23 
 
 		 159 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>