105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3223 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 		 345 aa  712    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  64.5 
 
 		 339 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  61.33 
 
 		 353 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  60.12 
 
 		 353 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  59.82 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  55.03 
 
 		 344 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  48.64 
 
 		 347 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  46.57 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  46.22 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  43.67 
 
 		 354 aa  305  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  45.32 
 
 		 347 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  41.14 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  60.91 
 
 		 232 aa  295  6e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  41.57 
 
 		 342 aa  294  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  41.57 
 
 		 345 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  41.59 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  41.18 
 
 		 360 aa  289  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  39.95 
 
 		 387 aa  288  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  40 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  38.84 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  37.99 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  40.12 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  39.89 
 
 		 361 aa  272  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  38.86 
 
 		 364 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  41.14 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  35.86 
 
 		 381 aa  265  5.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  40.35 
 
 		 368 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  40.13 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  42.14 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  35.61 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  41.32 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  35.44 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  36.26 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  36.47 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  39.73 
 
 		 360 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  40.73 
 
 		 335 aa  232  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  34.21 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  41.84 
 
 		 264 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  34.13 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  33.23 
 
 		 339 aa  190  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  33.14 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  33.92 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  32.81 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  33.24 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  32.48 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  32.19 
 
 		 361 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  32.19 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  34 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  34.76 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  35.03 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  34.22 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  30.91 
 
 		 367 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  29.67 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  29.97 
 
 		 354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  32.47 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  31.95 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  32.13 
 
 		 378 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  32.13 
 
 		 378 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  32.13 
 
 		 378 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  32.55 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  31.8 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  36.36 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  32.18 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  33.65 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  32.81 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  29.68 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  30.95 
 
 		 388 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  29.46 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  34.06 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  32.94 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  36.6 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  31.02 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  30.19 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  26.89 
 
 		 389 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  29.01 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  32.19 
 
 		 393 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  32.66 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  27.73 
 
 		 357 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  35.45 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  45.99 
 
 		 160 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  47.22 
 
 		 167 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  30.53 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  27.27 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  29.12 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  28.04 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  27.76 
 
 		 378 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  34.15 
 
 		 371 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  27.84 
 
 		 407 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  28.18 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  31.82 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  33.98 
 
 		 384 aa  109  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  40.5 
 
 		 171 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  30.43 
 
 		 199 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2446  protein of unknown function DUF1016  31.65 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  45.88 
 
 		 154 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  30.95 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  33.72 
 
 		 178 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>