107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1129 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  100 
 
 		 407 aa  837    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  57.33 
 
 		 389 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  47.31 
 
 		 375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  43.94 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  47.58 
 
 		 333 aa  293  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  43.24 
 
 		 339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  41.73 
 
 		 400 aa  279  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  42.67 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  38.9 
 
 		 340 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  42.49 
 
 		 387 aa  262  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  56.25 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  38.18 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  37.92 
 
 		 387 aa  249  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  38.34 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  37.06 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  37.43 
 
 		 349 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  47.48 
 
 		 335 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  36.9 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  35.7 
 
 		 378 aa  232  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  35.7 
 
 		 378 aa  232  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  35.7 
 
 		 378 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  36.36 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  35.13 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.448482 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  36.1 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  37.68 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  34.2 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  34.55 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  33.94 
 
 		 367 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  33.94 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  32.73 
 
 		 384 aa  209  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  32.45 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  32.97 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  31.94 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  32.08 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  32.66 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  32.75 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  32.11 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  31.53 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  31.11 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  28.87 
 
 		 368 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  32.11 
 
 		 382 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  30.14 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  29.89 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  30.27 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  30.46 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  29.47 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  31.46 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  28.61 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  30.55 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  28.42 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  29.64 
 
 		 381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  29.02 
 
 		 353 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  31.09 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  30.55 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  29.72 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  30.61 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  28.35 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  37.14 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  29.04 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  29.22 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  30.34 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  28.01 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  30.53 
 
 		 343 aa  143  6e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  26.36 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  29.26 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  28.33 
 
 		 347 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  36.63 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  28.09 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  28.25 
 
 		 357 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  28.39 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  27.49 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  27.15 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  28.69 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  31.2 
 
 		 344 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  26.25 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  25.27 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  23.92 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  23.65 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  25.9 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  25.45 
 
 		 353 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  24.4 
 
 		 349 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  26.98 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  27.84 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  24.08 
 
 		 343 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  25.07 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  27.97 
 
 		 339 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  25.86 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  24.6 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  33.78 
 
 		 160 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  28.57 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  30.43 
 
 		 235 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  38.83 
 
 		 217 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  35.71 
 
 		 136 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1738  hypothetical protein  43.86 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  41.33 
 
 		 71 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  21.71 
 
 		 232 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>