92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0486 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  329  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  329  7.000000000000001e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  329  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  280  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  277  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  94.81 
 
 
375 aa  261  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  230  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  69.29 
 
 
361 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  69.29 
 
 
367 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  66.42 
 
 
367 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  75.25 
 
 
367 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  61.39 
 
 
378 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  51.2 
 
 
387 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  61.39 
 
 
378 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  51.2 
 
 
387 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  61.39 
 
 
378 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  61.86 
 
 
341 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  52.46 
 
 
389 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  48.82 
 
 
388 aa  117  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  42.06 
 
 
389 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  65.75 
 
 
71 aa  92.8  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  45.37 
 
 
217 aa  92  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  42.34 
 
 
350 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  49.45 
 
 
359 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  45 
 
 
340 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4863  hypothetical protein  62.5 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3302  hypothetical protein  62.5 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  42.71 
 
 
349 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  41.67 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  35.71 
 
 
407 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  46.67 
 
 
351 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  42.7 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  45.95 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2724  hypothetical protein  60.87 
 
 
51 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  37.78 
 
 
335 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  39.18 
 
 
354 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  35.83 
 
 
370 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  28.03 
 
 
368 aa  58.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  37.78 
 
 
364 aa  57.8  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  29.36 
 
 
339 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4509  protein of unknown function DUF1016  39.02 
 
 
235 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  38.37 
 
 
347 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  44.12 
 
 
344 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  28.23 
 
 
381 aa  54.7  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  39.24 
 
 
342 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  41.1 
 
 
387 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  33.33 
 
 
364 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  29.67 
 
 
365 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  33.33 
 
 
368 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  32.63 
 
 
342 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  31.3 
 
 
355 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  27.13 
 
 
358 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  28.46 
 
 
347 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  35.96 
 
 
369 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  31.58 
 
 
350 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  36.49 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  34.52 
 
 
341 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  30.84 
 
 
232 aa  51.6  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  34.52 
 
 
364 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  40.85 
 
 
323 aa  50.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  27.21 
 
 
382 aa  50.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1812  hypothetical protein  47.17 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00195671  hitchhiker  0.00000000124533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  38.24 
 
 
378 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  30.39 
 
 
358 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  35.8 
 
 
353 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1738  hypothetical protein  49.06 
 
 
70 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  35.29 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  34.74 
 
 
348 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  31.37 
 
 
347 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  30.53 
 
 
358 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  32.56 
 
 
343 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  36.89 
 
 
400 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  26.37 
 
 
345 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  32.22 
 
 
356 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  29.13 
 
 
357 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  30 
 
 
345 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  27.27 
 
 
344 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  32.95 
 
 
384 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  25.56 
 
 
337 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  34.62 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  36.36 
 
 
381 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3548  hypothetical protein  36.84 
 
 
72 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.936527  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  28.57 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  26.53 
 
 
338 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  35.71 
 
 
361 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  30.69 
 
 
343 aa  41.2  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  30.38 
 
 
360 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  31.08 
 
 
353 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  31.08 
 
 
353 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  32.93 
 
 
371 aa  40.8  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  35 
 
 
376 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>