38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1812 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1812  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  202  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00195671  hitchhiker  0.00000000124533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  37.5 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  45.28 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  50 
 
 		 339 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  36 
 
 		 354 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  44.26 
 
 		 349 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  47.17 
 
 		 375 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03030  hypothetical protein  45.28 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0486  hypothetical protein  47.17 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03079  hypothetical protein  47.17 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  43.4 
 
 		 350 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3407  hypothetical protein  47.17 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  57.5 
 
 		 407 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  52.5 
 
 		 375 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  41.86 
 
 		 389 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  39.22 
 
 		 341 aa  47.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  33.77 
 
 		 355 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1738  hypothetical protein  44 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  31.76 
 
 		 335 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1618  hypothetical protein  44 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  27.91 
 
 		 364 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  35.09 
 
 		 351 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  27.96 
 
 		 364 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  26.97 
 
 		 365 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  38.6 
 
 		 344 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  50 
 
 		 375 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  35.71 
 
 		 378 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  35.71 
 
 		 378 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  40 
 
 		 387 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  40 
 
 		 387 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  35.71 
 
 		 378 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  36.36 
 
 		 340 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  29.55 
 
 		 389 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  31.4 
 
 		 369 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  30.26 
 
 		 358 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  29.11 
 
 		 347 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  39.02 
 
 		 388 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  36.92 
 
 		 358 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>